Protéinogenèse
Définition
En biochimie, une protéinogenèse est une biosynthèse pour une protéine, la synthèse d'une protéine. Les acides aminés protéinogènes sont des acides aminés qui sont incorporés directement dans la chaîne peptidique lors de la traduction du code génétique en polypeptide.
Un oeuf a 20 acides aminés protéinogènes :
Un oeuf de poule contient 20 des 23 acides aminés protéinogènes.
Acides aminés protéinogènes
Un acide aminé protéinogène est n'importe lequel des 23 acides α-aminés qui sont des précurseurs de protéines et qui leur sont incorporés pendant la traduction. Un acide aminé protéinogène est un acide carboxylique et un composé organo-azoté.
Parmi les 23 acides aminés génétiquement codés (protéinogènes), 20 sont dans le code génétique standard et 3 (pyrrolysine, sélénocystéine, N-formylméthionine) ne sont incorporés que par des mécanismes de traduction spéciaux.
Les acides aminés protéinogènes :
Liste et structure des 22 acides aminés protéinogènes (sur 23 en tout).
La pyrrolysine, la sélénocystéine et et la N- formylméthionine ne se rencontrent que chez les eucaryotes (et quelques oxydoréductases).
Un oxoacide est une entité moléculaire capable de donner un hydron à un accepteur (acide de Brønsted).
Liste des acides aminés protéinogènes
Les 23 acides α-aminés protéinogènes sont :
- N-formylméthionine;
- L-alanine;
- L-arginine;
- L-asparagine;
- L-acide aspartique;
- L-cystéine;
- L-glutamine;
- L-acide glutamique;
- glycine;
- L-histidine;
- L-isoleucine;
- L-leucine;
- L-lysine;
- L-méthionine;
- L-phénylalanine;
- L-proline;
- L-pyrrolysine;
- L-sélénocystéine;
- L-sérine;
- L-thréonine;
- L-tryptophane;
- L-tyrosine;
- L-valine.
Hormis la glycine (qui est non chirale) et la formylméthionine, tous ont une configuration L.
Acides aminés non protéinogènes
En plus des acides aminés favorisant la protéinogenèse, il existe également des acides aminés pour lesquels aucun codon n'existe, qui sont appelés acides aminés non protéinogènes.
Certains d'entre eux jouent un rôle dans les systèmes biologiques, d'autres ne sont connus que sous le nom de curiosité de laboratoire. Des acides aminés non protéinogènes peuvent exister dans les peptides. Pendant la traduction, une substance de départ est d'abord incluse dans la chaîne polypeptidique, après quoi cette substance de départ est convertie en l'acide aminé souhaité dans une modification post-traductionnelle.
La présence d'acides aminés non protéinogènes dans les peptides a souvent pour résultat que les organismes contenant ces peptides sont toxiques pour leurs ennemis naturels.
Synonymes, antonymes
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