Polypeptide

Définition

Un polypeptide est un peptide de taille suffisamment grande avec au moins 10 acides aminés pour former une chaîne polypeptidique. Lorsque le polypeptide est volumineux (au moins 50 à 100 acides aminés) en présentant une structure tridimensionnelle unique et stable, il est une protéine.

Structure des chaînes polypeptidiques d'un polypeptide :

Les chaînes polypeptidiques d'un polypeptide sont montrées dans ce diagramme schématique de la liaison hydrogène dans le motif structurel d'un feuillet alpha plissée.

Explications

Le feuillet alpha (α) plissé polaire est une structure secondaire atypique de protéines (et des polypeptides), proposée pour la première fois par Linus Pauling et Robert Corey en 1951. Le modèle de liaison hydrogène dans un feuillet α est similaire à celle d'un feuillet B (β), mais l'orientation des groupes carbonyle et amino dans les unités de liaison peptidique est distinctive.

Les polypeptides peuvent être d'origine naturelle ou artificielle. Par exemple, l'occludine est un polypeptide protéique de 522 acides aminés.

Classification des peptides

La classification des peptides en fonction du nombre d'acides aminés dans leur chaîne n'est pas claire, ni universellement acceptée. À titre approximatif, on peut parler de :

• peptide : à partir d'1 acide aminé
• oligopeptide : de 2 à 10 acides aminés (dipeptide : 2, tripeptide :3)
• polypeptide : de 10 à 100 acides aminés
• protéine : plus de 100 acides aminés

Les protéines à une seule chaîne polypeptidique sont appelées protéines monomères, tandis que celles composées de plus d'une chaîne polypeptidique sont appelées protéines polymères (comme les extensines par exemple).

Les protéines sont des composés organiques formés par l'association d'alpha-aminoacides. Ce sont des polymères, c'est-à-dire de grosses molécules, constitués de monomères appelés acides aminés.

Le terme polypeptide ou peptide désigne un polymère linéaire de deux acides aminés ou plus, établissant des liaisons peptidiques intervenant entre le groupe carboxyle d'un acide aminé et le groupe amino d'un autre. Lorsque ces groupes se lient, la formation d'eau (réaction de déshydratation) survient en raison de la perte d'un hydroxyle du groupe carboxyle et de l'hydrogène du groupe amine.

Les peptides diffèrent les uns des autres par le nombre d'acides aminés et par la séquence de ces molécules. En fonction du nombre d'acides aminés dont ils disposent, on peut les classer en dipeptides, lorsqu'ils sont formés de deux acides aminés; tripeptides, quand ils sont formés par trois; les tétrapeptides, quand ils sont formés de quatre acides aminés, et ainsi de suite. Lorsque nous avons plusieurs acides aminés liés, nous utilisons le terme polypeptide. Un peptide de plus de soixante-dix acides aminés est appelé protéine.

Les polypeptides sont différents des oligopeptides en raison du nombre d'acides aminés qui les constituent. L'oligopeptide est un peptide fabriqué avec peu d'acides aminés et les polypeptides sont des peptides composés de nombreux acides aminés.

Un polypeptide a une structure primaire (séquence d'acides aminés) et des liaisons peptidiques entre les acides aminés.

Maladies

Dans la drépanocytose, une maladie héréditaire, un changement intervient dans la structure primaire de l'une des chaînes polypeptidiques formant l'hémoglobine : l'acide aminé acide glutamique (GLU) est remplacé par un acide aminé valine (VAL) dans la chaîne bêta.

La "conformation" spatiale de la molécule est également affectée par cette "erreur" de la chaîne primaire, ce qui a pour effet que les globules rouges contenant cette hémoglobine ont une forme différente de faucille (donc en forme de faucille, "en forme de faucille"). Ces cellules modifiées finissent par former des amas de cellules qui obstruent les vaisseaux sanguins périphériques, provoquant une hypoxie (manque d'oxygène) et des accès de douleur intense.

Résumé

Un polypeptide est un peptide qui se compose d'au moins dix acides aminés liés par des liaisons peptidiques. Les polypeptides peuvent être d'origine aussi bien naturelle que synthétique. Les chaînes de polypeptides contenant plus de 100 acides aminés sont généralement appelées protéines; cependant, des exigences supplémentaires sont nécessaires pour une protéine, telle qu'un certain repliement des protéines.

Les macropeptides sont des peptides de haut poids moléculaire. Si ceux-ci sont reliés par des ponts hydrogène ou disulfure, on parle souvent de protéines. Cependant, certaines chaînes d'acides aminés contenant plus de 100 acides aminés sont uniquement appelées peptides.

En rapport avec "polypeptide"

• dipeptide

  

  Un dipeptide est une molécule composée de deux peptides, la forme la plus simple d'un polypeptide de type oligopeptide.

• glycopeptide

  

  Un glycopeptide est un composé formé d'un peptide de glycoprotéine et d'une partie glucidique. Les antibiotiques glycopeptidiques constituent une classe...

• lipopeptide

  

  Un lipopeptide est une molécule constituée d'un lipide connecté à un peptide. Les lipopeptides sont typiques du monde bactérien, en étant capables...

• neuropeptide

  

  Un neuropeptide est une petite molécule, formée par l'union de 3 acides aminés ou plus et est un peptide qui montre une action sur le système nerveux.