Arabinose
Définition
Un arabinose est un aldopentose constitutif de nombreux polysaccharides végétaux. L'arabinose est un sucre simple naturel (monosaccharide) qui se compose de cinq atomes de carbone (pentose). L'arabinose est parfois appelé pectinose, sucre de gomme ou sucre d'aloïne.
La formule brute est : CH2OH-(CHOH)3CHO. Une L–arabinose isomérase (EC 5.3.1.4) est une enzyme qui a un substrat, le L–arabinose, et un produit, le L-ribulose. Voir l'arabane.
La version isomérase du L–arabinose de E. coli :
La structure de la L–arabinose isomérase de la bactérie Escherichia coli. La dégradation de la L–arabinose dans E. coli est contrôlée par l'opéron ara. Le L–arabinose est-il présent dans la cellule, qui est la transcription d'un promoteur activé et l'ARNm synthétisé dérivé du gène araA apparent, peut, après traduction dans la L–arabinose isomérase, être converti. La L–arabinose isomérase convertit le L–arabinose en L-ribulose.
Explications
L'enzyme arabinose appartient à la famille des isomérases, en particulier les oxydoréductases intramoléculaires interconvertissant les aldoses et les cétoses. Le nom systématique de cette classe d'enzymes est L–arabinose aldose-cétose-isomérase. Cette enzyme participe aux interconversions du pentose et du glucuronate. Cette enzyme catalyse la conversion du L–arabinose en L-ribulose comme première étape de la voie d'utilisation du L–arabinose comme source de carbone.
L'arabinose à chaîne ouverte est diastéréoisomérique des trois autres aldopentoses ribose, xylose et lyxose. En tant que composé chiral, il se compose des deux énantiomères D-(-)-arabinose et L-(+)-arabinose. La forme L est plus fréquente dans les aliments, principalement en tant que composant des chaînes polysaccharidiques du règne végétal. Comme les autres sucres, il a un goût sucré. La forme D a été utilisée comme composant d'un polysaccharide dans la tuberculose - bacilles détectés.
Les deux isomères constitutionnels cycliques arabinofuranose et arabinopyranose sont obtenus par formation d'hémiacétal intramoléculaire. Puisqu'un autre centre d'asymétrie apparaît pendant la formation de l'hémiacétal, il existe deux diastéréoisomères, l'α- et β-arabinofuranose et l'α- et β-arabinopyranose. Les paires α- et β-furanose ou α- et β-pyranose sont également appelées anomères.
En solution aqueuse, les arabinofuranoses anomères et les arabinopyranoses sont en équilibre l'une avec l'autre via la forme aldéhyde instable à chaîne ouverte. L'équilibre est dominé à 61 % par l'α-arabinopyranose, suivi par le β-arabinopyranose à 35 %. Les deux arabinofuranoses ne jouent qu'un rôle mineur avec 2 % chacune. L'équilibre est la mutarotation référencée. L'arabinose ne peut pas être fermenté par une levure ordinaire. En 2005, des chercheurs de l'Université Goethe de Francfort-sur-le-main ont réussi à modifier les cultures de levures afin qu'elles puissent également fermenter l'arabinose et le xylose pour produire de l'éthanol.
Opéron
L'opéron arabinose est un opéron qui régule la dégradation de l'arabinose et existe dans la bactérie E. coli, entre autres. L'opéron L–arabinose de la bactérie modèle Escherichia coli est un sujet de recherche en biologie moléculaire depuis plus de 40 ans et a été largement étudié aux niveaux génétique, biochimique, physiologique et biophysique. Il est animé par un double système positif et négatif. Il existe trois gènes structurels : araB, araA et araD. Ils codent les enzymes métaboliques pour décomposer le monosaccharide sucre arabinose en D-xylulose-5-phosphate, qui est ensuite métabolisé par la voie du pentose phosphate. La "région initiateur", qui contient à la fois un site opérateur et un site promoteur, est appelée araI (la dernière lettre est le "i" majuscule). Près de ce site se trouve le gène araC, qui code pour une protéine d'activation. La protéine AraC se lie à la région initiateur araI.
Synonymes, antonymes
2 synonymes (sens proche) de "arabinose" :
- pectinose
- sucre de gomme
0 antonyme (sens contraire).
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