Cytidine
Définition
La cytidine est un ribonucléoside, un nucléoside pyrimidique dans lequel la cytosine est liée au ribose via une liaison β-N1-glycosidique. La cytidine est un précurseur de l'uridine. La cytidine et l'uridine sont toutes deux utilisées dans la synthèse d'ARN. La cytidine-5′-monophosphate, diphosphate ou triphosphate représente, par exemple pour la cytidine-5′-monophosphate, un synonyme de l'acide cytidylique.
La structure de la cytidine :
La structure des analogues de la cytidine. La cytidine est une pyrimidine qui, en plus d'être incorporée dans les acides nucléiques, peut servir de substrat pour la voie de récupération de la synthèse des nucléotides pyrimidiques.
Explications
La cytidine (symbole C ou Cyd) est une molécule nucléoside qui se forme lorsque la cytosine est attachée à un cycle ribose (également connu sous le nom de ribofuranose) via une liaison β-N1-glycosidique. La cytidine est un composant de l'ARN. Si la cytosine est attachée à un cycle désoxyribose, elle est connue sous le nom de désoxycytidine. La cytidine est un nucléoside pyrimidique dans lequel la cytosine est attachée au ribofuranose via une liaison bêta-N(1)-glycosidique.
Voir aussi un ribonucléotide. Les analogues de nucléosides comme l'arabinosyl-5-azacytidine rivalisent avec leurs homologues physiologiques pour l'incorporation dans les acides nucléiques.
La cytidine-5-diphosphocholine (CDP-choline ou citicholine) est une molécule essentielle nécessaire à la biosynthèse des membranes cellulaires. Chez l'homme adulte, il est utilisé comme médicament améliorant la mémoire pour le traitement de la démence liée à l'âge et des affections cérébrovasculaires.
La cytidine en position d'oscillation de l'ARNt est souvent modifiée soit dans le sucre soit dans la base avec des groupes fonctionnels qui favorisent la conformation du sucre 3′-endo au niveau du nucléoside.
Intérêt conjoint avec l'uridine
La cytidine et l'uridine sont absorbées par les cellules et la cytidine est désaminée en uridine. L'uridine est phosphorylée pour former des nucléotides uracile par l'uridine kinase, une monophosphate kinase - spécifique de l'uridine monophosphate (UMP), CMP et d CMP - et une nucléoside diphosphokinase non spécifique (voir une phosphofructokinase).
Il y a 15 acides aminés acides et 15 acides aminés basiques dans la séquence. Grâce à l'analyse de la structure tridimensionnelle, la structure secondaire de chaque sous-unité de la cytidine désaminase humaine contient quatre hélices alpha, deux, 3/10 hélices, cinq feuillets bêta et un tour alpha.
L'ara-C doit être converti en sa forme active, l'ara-CTP, par l'action séquentielle de trois enzymes : (a) la désoxycytidine (CdR) kinase, (b) la désoxycytidine monophosphate (dCMP) kinase et (c) la nucléoside diphosphate (NDP) kinase. L'ara-C est sujet à dégradation par la cytidine désaminase, formant le produit inactif uracile arabinoside (ara-U).
Édition d'ARN (éditosome)
L'édition de l'ARN cytidine-uridine (C-to-U) de mammifère a été décrite pour la première fois comme une modification cotraductionnelle ou post-transcriptionnelle spécifique au site d'un seul résidu nucléotidique dans l'isoforme intestinale codant l'ARN messager de l'apolipoprotéine B (apoB). Bien que d'autres exemples d'édition d'ARN C-to-U de mammifères aient été décrits, la plupart des progrès substantiels dans la compréhension de la machinerie moléculaire pour l'édition d'ARN C-to-U ont émergé d'une étude détaillée de l'édition d'ARN apoB.
L'édition d'ARN C-to-U de l'ARNm d'apoB modifie un codon CAA dans le transcrit à matrice génomique (codant un résidu glutamine dans l'ARNm non édité) en un codon UAA et entraîne la terminaison de la traduction du transcrit édité. Le résultat net est que l'ARNm d'apoB édité code pour une protéine amino-terminale, tronquée en traduction, appelée à l'échelle centile apoB48. En revanche, l'ARNm d'apoB non édité code pour une protéine de pleine longueur, apoB100.
En considérant le contexte et les approches qui ont évolué pour l'utilisation de modèles de souris pour explorer la biologie de l'édition d'ARN C-à-U, plusieurs caractéristiques clés de ce processus méritent d'être soulignées. Celles-ci incluent la signification fonctionnelle de l'apoB par rapport à ses propriétés de transport des lipides, la partition spécifique à l'espèce et à l'organe de l'édition de l'ARNm de l'apoB C-à-U des mammifères, sa signification adaptative physiologique et évolutive et la relation de C-à-U.
La modification de la machinerie de l'ARN médie la désamination enzymatique de la cytidine ciblée dans l'ARNm de l'apoB.
En ce qui concerne l'utilisation de modèles de souris, il convient de reconnaître que pratiquement tous les exemples connus d'édition altérée de l'ARN C-à-U de l'apoB in vivo accompagnent et reflètent les altérations primaires de l'équilibre lipidique cellulaire (cholestérol et/ou triglycéride) et reflètent ainsi un programme intégré d'adaptation à des signaux développementaux, hormonaux, nutritionnels ou autres dans lesquels la lipogenèse tissulaire et/ou les fonctions de transport des lipides sont modifiées.
Synonymes, antonymes
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