Les microbes
Les microbes sont des micro-organismes souvent considérés comme des agents pathogènes responsables de la propagation de maladies. Ils ont évolué bien avant l'émergence des premières plantes et animaux et impactent nos vies d'une manière plus significative qu'il n'y paraît.
Des microbes :
Les microbes sont des organismes microscopiques comprenant surtout les bactéries, les levures et les virus. La salmonelle Salmonella typhimurium (en rouge) responsable du typhus est une bactérie pathogène.
Généralités
La diversité microbienne est véritablement stupéfiante, mais tous ces microbes peuvent être regroupés en cinq grands types : les bactéries, les archées, les champignons, les protistes et les virus.
Certains microbes nous rendent malades, tandis que d'autres sont essentiels à notre santé. Les plus courants sont les bactéries, les virus et les champignons. Il existe également des microbes appelés protozoaires. Ces minuscules organismes vivants sont responsables de maladies comme la toxoplasmose et le paludisme.
Un microbe, généralement unicellulaire, peut être détruit par un microbicide ou un antimicrobien (agent antimicrobien).
Les microbes peuvent être trouvés partout dans la nature, comme les extrêmophiles qui se rencontrent même dans les régions polaires, les déserts, les geysers et les lithobiontes qui peuvent vivre sur ou sous la surface des roches, à de grandes profondeurs dans la croûte terrestre et au fond de l'océan. En grand nombre, ils interviennent sur et dans les organismes (la peau, dans le tube digestif), dans le sol, dans l'eau et dans l'air. De nombreux microbes utilisent des résidus d'autres organismes comme aliment. Ils jouent un rôle majeur en biotechnologie (par exemple dans le brassage et la préparation du pain). Certains microbes peuvent également causer des maladies.
La limite maximale admissible pour l'ensemble des microbes (bactéries et moisissures) sur le lieu de travail est une concentration de 10 000 unités formant des colonies par mètre-cube (CFU/m3). En outre, une limite supérieure de 500 cfu/m3 a été mentionnée pour chaque type spécifique de microbe. Pour les bactéries à Gram négatif, une limite de 1 000 cfu/m3 est proposée, en raison des effets d'une exposition possible aux endotoxines (un composant de la membrane externe des bactéries Gram-négatives, qui est toxique pour l'homme). Les valeurs mentionnées s'appliquent en règle générale et n'ont pas de statut juridique et aussi une base scientifique très pauvre basée sur la santé.
Au figuré, et en langage populaire, un microbe qualifie une personne de taille ou de force nettement inférieure à une autre. Voir aussi la mysophobie.
Lorsque le microbe devient très petit, on emploie exagérément le terme de nanobe ou encore nanobactérie. Il peut exister sous sa forme unicellulaire ou dans une colonie pluricellulaire. La plupart des micro-organismes sont microscopiques, mais il y en a certains comme Thiomargarita namibiensis, qui sont macroscopiques et visibles à l'oeil nu.
Contrairement aux virus, les bactéries, les archées, les protistes et les champignons sont tous des organismes cellulaires vivants. Ils possèdent un génome d'ADN et disposent d'une machinerie pour produire leurs propres protéines. Ils se divisent en deux groupes principaux selon leur structure cellulaire : les procaryotes et les eucaryotes.
Bactéries
Les bactéries sont des microbes unicellulaires classés dans les protozoaires. Parmi les bactéries les plus connues, on trouve les salmonelles et les staphylocoques.
Plusieurs formes de bactéries :
Les bactéries sont des microbes unicellulaires qui se présentent sous de nombreuses formes et tailles, telles que des bâtonnets, des sphères ou des spirales.
La plupart des bactéries ne sont pas dangereuses pour l'homme. Nombre d'entre elles vivent même sur ou dans notre corps et nous aident à rester en bonne santé. Par exemple, les bactéries lactiques présentes dans l'intestin nous aident à digérer les aliments. D'autres bactéries contribuent au système immunitaire en combattant les germes. Certaines bactéries sont également nécessaires à la production de certains aliments, comme le yaourt, la choucroute ou le fromage.
Moins de 1 % des bactéries provoquent des maladies, mais il ne s'agit que d'une estimation approximative, car il n'existe pas de chiffres précis. La tuberculose, par exemple, est causée par des bactéries. Les infections bactériennes peuvent être traitées par des antibiotiques. Ce sont des médicaments qui tuent les bactéries ou du moins les empêchent de se multiplier.
De nombreuses autres infections, comme la diarrhée, le rhume ou l'amygdalite, peuvent également être causées par des bactéries, mais elles sont généralement causées par des virus. Les antibiotiques ne sont pas efficaces contre les virus. Ce n'est donc pas une bonne idée de commencer à utiliser des antibiotiques trop tôt si vous n'êtes pas sûr qu'il s'agit d'une infection bactérienne.
Archées
Les bactéries et les archées sont des procaryotes ("pro" = avant, "caryote" = noyau). Ce sont des cellules uniques (unicellulaires) dont le génome d'ADN circulaire flotte dans le cytoplasme. De nombreux procaryotes possèdent un ou plusieurs petits cercles d'ADN, appelés plasmides, qui portent des gènes supplémentaires. Les bactéries et les archées ont une structure cellulaire très similaire. Elles n'ont ni noyau ni organites membranaires. Certains procaryotes possèdent des structures en forme de queue, appelées flagelles, qu'ils utilisent pour nager dans les liquides, ou des fimbriae qui leur permettent d'adhérer aux surfaces.
Les archées ressemblent aux bactéries en taille et en structure, mais présentent une plus grande variété de formes cellulaires. De nombreuses archées vivent dans des environnements hostiles, certaines interagissent avec d'autres organismes, mais aucune n'est connue pour provoquer des maladies. Contrairement aux bactéries, leurs parois cellulaires sont dépourvues de peptidoglycane. De nombreuses archées vivent dans des environnements extrêmes, notamment Haloquadratum (Figure 5), dont les cellules sont ultrafines (0,25 µm) et carrées. On la trouve partout dans le monde dans des lacs salés jusqu'à dix fois plus salés que l'eau de mer en raison de l'évaporation; tellement salée qu'elle vous tuerait si vous la buviez !
Virus pathogènes
Les microbes peuvent être des virus qui envahissent les cellules saines et nous rendent malades.
Contrairement aux bactéries, les virus ne possèdent pas de cellules propres. Cela signifie qu'ils ne sont pas, à proprement parler, des organismes vivants. Ils sont plutôt constitués d'une ou plusieurs molécules entourées d'une enveloppe protéique. L'information génétique contenue dans cette enveloppe est nécessaire à leur reproduction.
De nombreux virus provoquent des maladies. Certains sont inoffensifs et ne provoquent qu'un léger rhume, tandis que d'autres peuvent provoquer des maladies graves comme le SIDA. Parmi les autres maladies causées par des virus, on trouve la COVID-19, la grippe, la rougeole et l'inflammation du foie (hépatite virale).
Les virus envahissent les cellules saines et commencent à se multiplier à partir de ces cellules. Un virus ne peut se reproduire sans ces cellules hôtes. Tous les virus ne provoquent pas de symptômes et, dans de nombreux cas, l'organisme parvient à lutter contre ses agresseurs. C'est le cas des virus de l'herpès labial, que de nombreuses personnes contractent à un moment ou à un autre. Ces virus restent inactifs dans certaines cellules nerveuses. Chez certaines personnes, ils provoquent les ulcères labiaux typiques lorsque leur système immunitaire est affaibli ou affaibli.
Il est assez difficile de combattre les virus avec des médicaments. Pour se protéger contre certains virus, le système immunitaire peut être "formé" par la vaccination afin que l'organisme soit mieux préparé à les combattre.
Les virus sont les plus petits microbes. Leur génome est composé d'ADN ou d'ARN (mais pas des deux), et celui-ci est enrobé dans une enveloppe protéique appelée capside. Ils ne sont pas constitués de cellules (acellulaires), ne peuvent pas fabriquer leurs propres protéines et ne se développent pas. Ils doivent infecter une cellule hôte et détourner sa machinerie pour assembler de nouveaux virus. Les virus ne peuvent généralement infecter qu'un nombre limité d'espèces d'organismes vivants. Les bactériophages (Figure 1) sont des virus qui infectent les bactéries. Dans certains pays, ils sont utilisés pour traiter les infections bactériennes et la phagothérapie connaît un regain d'intérêt en raison de l'augmentation alarmante des infections résistantes aux antimicrobiens.
Certains virus possèdent une enveloppe lipidique qu'ils volent aux membranes de la cellule hôte. Un exemple de virus enveloppé que vous connaissez grâce aux articles de presse (et dont vous avez probablement personnellement subi les effets) est le virus responsable de la grippe. La pandémie de grippe de 1918–1919 a été la pire épidémie jamais enregistrée, infectant un tiers de la population mondiale et tuant environ 50 millions de personnes. Un autre exemple est le SARS-COV-2, responsable de la pandémie actuelle de Covid-19. La plupart des scientifiques s'accordent donc à dire que les virus doivent être considérés comme non vivants.
Champignons
Les microbes peuvent prendre la forme de champignons qui sont très répandus sur Terre. Les champignons peuvent vivre dans des environnements très variés. Les plus connus sont les levures, les moisissures et les champignons comestibles. Tout comme les bactéries, certains champignons sont naturellement présents sur la peau ou dans l'organisme. Mais ils peuvent aussi provoquer des maladies.
Les maladies causées par des champignons sont appelées mycoses. Le pied d'athlète ou les mycoses des ongles en sont des exemples courants. Les mycoses peuvent également provoquer des inflammations des poumons, des muqueuses buccales ou des organes reproducteurs. Ces inflammations peuvent être mortelles chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli.
Certains champignons peuvent également contribuer à lutter contre les maladies. Par exemple, une moisissure produit naturellement de la pénicilline, un antibiotique qui combat les bactéries.
En rapport avec "microbe"
Un antimicrobien est une substance chimique, naturelle ou synthétique qui tue les micro-organismes ou inhibe leur croissance.
Une bactérie pathogène est une bactérie qui cause une maladie infectieuse chez les humains, les animaux ou les plantes.
Une nanobactérie est un micro-organisme bactérien, un microbe de la taille d'un nanobe.
Un virus est un agent infectieux microscopique, acellulaire, qui ne peut se multiplier que dans les cellules d'autres organismes.