Phycobiline
Définition
La phycobiline est un pigment accessoire photosynthétique soluble dans l'eau trouvé dans les algues rouges et les cyanobactéries. Une phycobiline distingue un chromophore formé d'un groupe tétrapyrrolique non cyclique, responsable de la capture de l'énergie lumineuse et de la couleur des pigments de certaines algues. Les phycobilines sont les groupements prosthétiques des phycobiliprotéines, formant une biliprotéine pigmentaire des algues rouges et cyanobactéries.
La phycocyanobiline est une phycobiline :
Les phycobilines sont des protéines hydrosolubles (comme cette phycocyanobiline) qui captent l'énergie lumineuse dans les cyanobactéries et dans les chloroplastes de certaines algues (Rhodophytes, cryptomonades, glaucocystophytes).
Explications
Une phycobiline désigne un groupement prosthétique chromophore tétrapyrrolique à chaîne ouverte des phycobiliprotéines, pigments des Rhodophycées et des cyanobactéries.
L'une des caractéristiques distinctives des phycobilines est leur solubilité dans l'eau. Contrairement aux caroténoïdes insolubles dans l'eau, les phycobilines sont des protéines hydrosolubles.
La phycobiline est un type de pigment utilisé dans le processus de photosynthèse de certaines algues, en particulier les algues rouges (phycoérythrines). Ce pigment est responsable de la capture de l'énergie lumineuse par des rayonnements de différentes longueurs d'ondes de ceux capturés par les chlorophylles. Le nom dérive des bilines.
Les autotrophes photosynthétiques ont des pigments qui absorbent l'énergie lumineuse pour synthétiser des matières organiques complexes à partir de sources inorganiques. Il existe trois types de base de pigments photosynthétiques : les chlorophylles, les caroténoïdes et les phycobilines. Il existe quatre types de phycobilines :
- la phycoérythrobiline (absorbe le rouge);
- la phycocyanobiline (absorbe le bleu);
- la phycourobiline (absorbe l'orange);
- la phycoviolobiline (absorbe le violet).
Les principaux représentants sont la phycocyanobiline (dans la phycocyanine, le bleu) et la phycoérythrobiline (dans la phycoérythrine, rouge). Les chromoprotéines correspondantes, les phycobiliprotéines, comprennent une partie protéique et le groupe chromophore, qui sont similaires aux dérivés de la porphyrine (chlorophylle et hémoglobine) de quatre cycles pyrrole interconnectés, mais pas dans un ensemble cyclique mais linéaire. Contrairement aux chlorophylles et aux caroténoïdes, le chromophore est lié de manière covalente à la protéine, c'est-à-dire à un groupe prothétique.
Les phycobilines couvrent les plages de longueurs d'onde de la photosynthèse dans lesquelles la chlorophylle n'absorbe pas. L'énergie piégée est transférée de la phycoérythrine éventuellement à la phycocyanine et de la phycocyanine à la chlorophylle. L'efficacité quantique des phycobilines est même supérieure à celle de la chlorophylle.
À l'aide de ces pigments accessoires, les cyanobactéries peuvent coloniser des zones faiblement lumineuses, telles que la face inférieure des blocs rocheux ou les couches d'eau profondes. Vous pouvez également utiliser l'espace vert d'absorption de la chlorophylle.
Les phycobilines se trouvent dans les algues rouges et les cryptomonades. On les retrouve également dans les cyanobactéries. À l'intérieur des cellules de ces organismes, les phycobilines collectent l'énergie lumineuse du soleil et transmettent cette énergie au pigment primaire, qui est la chlorophylle. Chez les eucaryotes comme les algues rouges, on les trouve dans le stroma du chloroplaste. Chez les procaryotes tels que les cyanobactéries, ils se trouvent dans le cytoplasme. L'énergie lumineuse qu'ils absorbent est essentielle à la production de molécules organiques par le processus de photosynthèse.
Phycourobiline
La phycourobiline est un chromophore de couleur orange qui entre dans la composition des phycobiliprotéines. La phycourobiline est une molécule tétrapyrrole impliquée dans la photosynthèse chez les cyanobactéries et les algues rouges. Ce chromophore est lié à la phycoérythrine phycobiliprotéine, la composante distale du système de récolte de la lumière des cyanobactéries et des algues rouges (phycobilisome). Elle dérive d'une phycoérythrobiline.
La phycourobiline issue de la phycoérythrobiline :
structures chimiques de la phycoérythrobiline (PEB) et de la phycourobiline doublement liée (PUB). La fixation post-traductionnelle des pigments est catalysée par des lyases de bilin ou des isomérases de lyase avec une liaison thioéther au carbone 3 1 du cycle biline A lors d'une fixation simple ou en plus à travers le carbone 18 1 du cycle D biline lorsqu'il est doublement fixé.
Lorsqu'elle est liée à la phycoérythrine, la phycourobiline montre un maximum d'absorption autour de 495 nm. Ce chromophore est toujours un chromophore donneur de phycoérythrines, puisque leur chromophore accepteur est toujours la phycoérythroline. Il peut également être lié aux polypeptides lieurs du phycobilisome, dont le rôle précis reste incertain.
La phycourobiline se trouve dans les organismes contenant du phycobilisome marin, ce qui leur permet d'absorber efficacement la lumière bleu-vert. Dans la cyanobactérie marine Synechococcus, la quantité de phycourobiline dans les phycobilisomes est corrélée à la niche écologique dans laquelle vivent les cellules : les Synechococcus de pleine mer sont très riches en phycourobililines, tandis que les Synechococcus côtiers contiennent très peu ou pas de phycourobiline. Cela représente une adaptation remarquable du système de récolte de lumière cyanobactérienne, car les eaux océaniques sont plus riches en lumière bleue que les eaux côtières.
La formule chimique est C33H42N4O6 pour une masse molaire de 590,710 Da.
Synonymes, antonymes
2 synonymes (sens proche) de "phycobiline" :
0 antonyme (sens contraire).
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Mots en P à proximité
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En rapport avec "phycobiline"
La phycocyanobiline est un chromophore entrant dans la composition des phycobiliprotéines.
La phycoérythrobiline est une phycobiline rouge, un chromophore entrant dans la composition des phycobiliprotéines.
La stercobiline est un pigment biliaire tétrapyrrole brun. La substance apparaît lors de la dégradation de la bilirubine au cours de la digestion intestinale...
L'urobiline est un pigment tétrapyrrolique orangé, une substance chromogène qui résulte de l'oxydation à l'air de l'urobilinogène.