Synthétase
Définition
Une synthétase (EC6), ou une ligase, désigne une classe d'enzymes qui catalysent une synthèse couplée à la rupture d'une liaison à haut potentiel énergétique d'un nucléotide triphosphate. Elle catalyse la liaison de deux molécules par une liaison covalente.
L'aminoacyl-ARNt synthétase :
Rôle de l'enzyme aminoacyl-ARNt synthétase (aaRS) dans la traduction du code génétique en catalysant l'attachement spécifique des acides aminés à leurs ARNt apparentés.
Explications
Attention de ne pas confondre synthétase et synthase. Une synthase se différencie d'une synthétase par l'utilisation d'un nucléotide triphosphate tel que l'ATP pour catalyser une réaction. L'ancien nom synthétase pour une ligase est encore souvent utilisé comme synonyme de ligases qui consomment de l'ATP. Les synthétases ne doivent pas être confondues avec les synthases qui ne nécessitent pas d'énergie supplémentaire pour la réaction d'addition.
La nomenclature biochimique a parfois distingué les synthétases des synthases et parfois traité les mots comme synonymes. Selon une définition, les synthases n'utilisent pas l'énergie des nucléosides triphosphates (tels que l'ATP, le GTP, le CTP, le TTP et l'UTP), tandis que les synthétases utilisent des nucléosides triphosphates. On dit aussi qu'une synthase est une lyase (une lyase est une enzyme qui catalyse la rupture de diverses liaisons chimiques par d'autres moyens que l'hydrolyse et l'oxydation, formant souvent une nouvelle double liaison ou une nouvelle structure en anneau) et ne nécessite aucune énergie, alors qu'une synthétase est une ligase (une ligase est une enzyme qui lie deux produits chimiques ou composés) et nécessite donc de l'énergie. Cependant, la Commission mixte sur la nomenclature biochimique (JCBN) impose que la "synthase" puisse être utilisée avec n'importe quelle enzyme qui catalyse la synthèse (qu'elle utilise ou non des nucléosides triphosphates), alors que la "synthétase" doit être utilisée comme synonyme.
Voir aussi cystathionine synthétase, et dans le cadre de l'ATP, l'ADN et l'ARNt, voir l'ATP synthétase, l'ADN ligase et l'aminoacyl-ARNt. Les aminoacyl-ARNt synthétases sont un autre groupe biologiquement important de ligases. Tout en utilisant l'ATP, ces enzymes chargent un ARNt avec son acide aminé spécifique dans une liaison ester d'acide carboxylique et appartiennent donc à la classe 6.1.
D'autres classes d'enzymes sont les : oxydoréductases (EC1), transférases (EC2), hydrolases (EC3), lyases (EC4), isomérases (EC5) et translocases (EC7).
Les carboxylases sont un autre groupe important de ligases en biochimie. Ces enzymes stockent le dioxyde de carbone sous forme d'ions carbonate sur d'autres molécules (EC 6.4.1.), Par exemple la pyruvate carboxylase.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "synthétase" :
0 antonyme (sens contraire).
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