Aminoacyl-adénylate
Définition
En génétique avec l'acide ARNt, un aminoacyl-adénylate est un acide aminé activé par un AMP (acide adénylique, adénosine monophosphate) lié à son groupement carboxyle. Cette liaison apporte l'énergie nécessaire à la fixation de l'acide aminé sur l'ARNt avant son utilisation lors de la traduction d'un ARNm en protéines.
L'aminoacyl-adénylate (aminoacyl-ARNt synthétase) :
aaRS (aminoacyl-adénylate ou aminoacyl-ARNt synthétases) comme cibles antifongiques potentielles. (A) structures chimiques des inhibiteurs AaRS. (B) Mode de liaison d'un inhibiteur de LeuRS (leucyl-ARNt synthétase).
Explications
Ces deux étapes que sont l'activation et la fixation de l'acide aminé sont catalysées par l'aminoacyl-ARNt synthétase (aaRS). Voir l'activation d'un acide aminé. Les étapes d'activation et de transfert pour un acide aminé particulier sont catalysées par la même aminoacyl- ARNt synthétase.
Voir aussi, pour un composé cyclique, l'AMP cyclique, pour la cyclase, l'adényl-cyclase, et la kinase, l'adényl-kinase.
Une aminoacyl-ARNt synthétase (aaRS) est une enzyme qui catalyse l'estérification d'un acide aminé spécifique (ou d'un précurseur) dans l'un des éventuels ARNt correspondants, afin de former un aminoacyl-ARNt.
L'aminoacylation, l'attachement d'un acide aminé à un ARNt, est généralement un processus en deux étapes catalysé par les aminoacyl-ARNt synthétases (aaRS). La forme de la courbe de temps pour l'aminoacylation de l'ARNt a été étudiée en utilisant cinq acides aminés différents : ARNt ligases. Avec les cinq ligases, la vitesse de transfert à l'état d'équilibre du complexe aminoacyl-adénylate préformé à l'ARNt était approximativement la même que celle de la réaction globale.
La synthétase se lie initialement à une molécule d'ATP et à l'acide aminé correspondant (ou à son précurseur) pour former un adénylate de non-aminoacyle avec libération d'une molécule de pyrophosphate. Le complexe adénylate-aaRS se lie alors à la molécule d'ARNt appropriée, et l'acide aminé est transféré de aa- AMP au 2′-oo 3′-OH de la dernière base d'ARNt (A76) à l'extrémité 3′ de la molécule. Certaines synthétases mesurent également la réaction de relecture, pour assurer une haute fidélité dans le chargement des molécules d'ARNt; si l'ARNt est mal chargé, la liaison aminoacyl-ARNt est hydrolysée.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "aminoacyl-adénylate" :
- aminoacyl-ARNt
0 antonyme (sens contraire).
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