Déadénylation
Définition
La déadénylation est l'étape majeure dans le déclenchement de la décomposition de l'ARNm (dégradation de l'ARNm). Elle entraîne l'inhibition de la traduction de l'ARNm dans les cellules eucaryotes. La déadénylation est l'élimination de la queue poly-A.
La déadénylation de l'ARNm :
La traduction et la décomposition des ARNm eucaryotes sont contrôlées par le raccourcissement de la queue poly(A) et la libération de la protéine de liaison poly(A) Pab1/PABP. Le complexe Ccr4-Not contient deux exonucléases - Ccr4 et Caf1/Pop2 - qui interviennent dans la déadénylation de l'ARNm.
Explications
La déadénylation induit également le remodelage de mRNP nécessaire à la formation de corps GW ou de corps de traitement d'ARN (corps P), qui hébergent des mRNP muets par traduction. Plusieurs exemples illustrent les rôles de la déadénylation dans la régulation de l'expression des gènes. Plusieurs sources de données indiquent que même si les mRNP non traduisibles peuvent être préparés ou assemblés en corps P de différentes manières, la déadénylation est toujours une étape nécessaire, et peut-être la plus précoce, dans les voies de désintégration de l'ARNm qui permettent le remodelage des mRNP requis pour la formation des corps P. Ainsi, la déadénylation et les déadénylases participantes ne sont pas simplement nécessaires pour préparer des substrats d'ARNm. Elles jouent un rôle indispensable à la fois structurellement et fonctionnellement dans la formation et la régulation des corps P.
Polyadénylation et déadénylation
Les deux des principales caractéristiques du cycle de vie de l'ARNm sont : clivage/polyadénylation et déadénylation. la longueur de la queue poly-A joue un rôle dynamique et essentiel dans le contrôle de l'expression des gènes. La transcription des ARNm aboutit au clivage de l'ARN et à un événement de polyadénylation coordonné à l'extrémité 3′.
Dans son cheminement vers la traduction, le transcrit résultant est soumis à une régulation constante par les protéines de liaison au capuchon, les miARN et les protéines de liaison à l'ARN, y compris les protéines de liaison poly(A) (PABP). L'interaction entre tous ces facteurs détermine si les exoribonucléases nucléaires ou cytoplasmiques accéderont à la queue poly(A) et la retireront, si essentielle à la stabilité et à la capacité de traduction de l'ARNm.
Lors d'une dégradation de l'ARN, le décollement dépendant de la déadénylation et les voies de dégradation 3′→5′ semblent être les seules voies générales de décomposition dans les cellules eucaryotes (dégradation intracellulaire). Ceci est basé sur les observations selon lesquelles si les deux voies sont inactivées dans la levure, les cellules sont incapables de se développer et les ARNm présentent une stabilité extrême. Cette observation indique également qu'un renouvellement efficace de l'ARNm est nécessaire pour la croissance et la division cellulaires.
Déadénylation de l'ARNm eucaryote
La déadénylation de l'ARNm eucaryote est généralement considérée comme un processus en deux étapes dans lequel le complexe PAN2–PAN3 initie la dégradation de la queue poly (A) tandis que, dans la deuxième étape, le complexe CCR4-NOT complète la déadénylation, conduisant au décapsulage et à la dégradation de l'ARNm.
Cependant, le mécanisme de la désadénylation biphasique de la queue poly-A reste énigmatique sur plusieurs points tels que le moment du basculement entre les deux étapes, le rôle de la terminaison de la traduction et la population d'ARNm impliquée. Ici, nous avons étudié la déadénylation des ARNm endogènes dans des cellules humaines appauvries en PAN3 ou en facteur de terminaison de la traduction eRF3. Parmi les ARNm testés, nous avons constaté que seul l'ARNm ATF4 endogène répond au modèle biphasique de déadénylation et que eRF3 empêche le raccourcissement de sa queue poly(A). Pour les autres ARNm, le faible effet de la déplétion en PAN3 sur le raccourcissement de leur queue poly(A) remet en question le mode de leur déadénylation. Il est possible que ces ARNm subissent un processus de déadénylation en une seule étape.
Alternativement, une désadénylation initiale très courte par PAN2-PAN3 peut être suivie d'une transition rapide vers la deuxième phase impliquant le complexe CCR4-NOT. Ces différences dans le moment du passage d'une étape de déadénylation à l'autre pourraient expliquer les difficultés rencontrées dans la généralisation du modèle de déadénylation biphasique.
Synonymes, antonymes
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1 antonyme (sens contraire) :
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