Mycobactérie

Définition

Une mycobactérie est une bactérie saprophyte du genre Mycobacterium, admise comme étant un micro-organisme vivant dans la terre, l'eau, et toute matière pouvant entrer en décomposition. Les mycobactéries apprécient particulièrement les conduites d'eau. Ces bactéries sont étudiées en mycobactériologie.

La lèpre et la tuberculose sont des exemples de maladies provoquées par des mycobactéries : elles sont combattues par des tuberculicides ou mycobactéricides.

La mycobactérie Mycobacterium tuberculosis :

La mycobactérie Mycobacterium tuberculosis est considérée comme la principale cause de tuberculose chez l'homme.

Explications

Un organisme mycobactériophage est un consommateur de mycobactéries. Certaines mycobactéries provoquent des infections appelées infections mycobactériennes atypiques. Elles ne sont pas "typiques" car elles ne causent pas la tuberculose. Mais elles peuvent encore nuire aux gens, en particulier aux personnes ayant d'autres problèmes qui affectent leur immunité, comme le SIDA.

Les mycobactéries peuvent être divisées en trois groupes :

• Complexe Mycobacterium tuberculosis, agent pathogène causal de la tuberculose;
• Mycobactéries non tuberculeuses (NTM);
• Mycobacterium leprae, agent pathogène causal de la lèpre.

Les mycobactéries sont des bactéries Gram-positives immobiles (en comparaison des salmonelles gram-négatives), à croissance lente, en forme de bâtonnet, avec une teneur élevée en G+C génomique (61 à 71 %). En raison de leurs caractéristiques de coloration spéciales au microscope, qui est médiée par l'acide mycolique dans la paroi cellulaire, elles sont dites acido-résistantes. C'est aussi la raison de la rusticité des mycobactéries.

Voir aussi les bactériophages.

Complexe Mycobacterium tuberculosis

Les agents pathogènes responsables de la tuberculose sont des mycobactéries appartenant au complexe M. tuberculosis. Ce complexe comprend les espèces suivantes :

• M. tuberculosis;
• M. bovis (subsp. bovis et caprae);
• souche vaccinale M. bovis BCG (bacille Calmette-Guérin);
• M. africanum;
• M. canettii;
• M. microti;
• M. pinnipedii.

Ces espèces sont, à l'exception de M. bovis BCG, considérées comme responsables de la tuberculose chez l'homme et l'animal. Malgré leur proche similitude génétique, ces organismes diffèrent considérablement en ce qui concerne l'épidémiologie, la pathogénicité et leur spectre d'hôtes.

En 1882, le médecin et microbiologiste allemand Robert Koch a découvert que M. tuberculosis était le pathogène causal de la phtisie. Sur la base de cette découverte, le diagnostic de la maladie pourrait être considérablement amélioré. Koch a publié ses résultats le 24 mars 1882 dans la Société de physiologie de Berlin. Par conséquent, le 24 mars est maintenant connu pour être la Journée mondiale de la tuberculose, initiée par l'Organisation mondiale de la santé (OMS).

Les infections tuberculeuses proviennent généralement de patients, qui souffrent de tuberculose pulmonaire active et donc infectieuse. Les agents pathogènes sont transmis par infection par gouttelettes dans l'air par la toux ou les éternuements. Le risque d'infection est accru par de mauvaises conditions d'hygiène et dans les zones densément peuplées. Comme les agents pathogènes infectent les cellules du système immunitaire, les macrophages, en particulier les nourrissons et les personnes immunodéprimées, sont à risque. Dans la plupart des cas, le système immunitaire réussit à combattre les bactéries ou à les encapsuler. Les mycobactéries peuvent alors persister dans l'organisme pendant plusieurs années sous forme de tuberculose latente sans provoquer de symptômes. On ne peut pas prédire quand et si la réactivation survient. Même si tous les organes peuvent être affectés, la maladie se manifeste par une tuberculose pulmonaire chez 80 % des patients.

M. bovis est la principale cause de tuberculose bovine. Elle peut être transmise à l'homme par la consommation de lait non pasteurisé ou dans de rares cas par inhalation de poussières dans les étables. De nos jours, cette infection est assez rare en Europe centrale car la population bovine est largement indemne de tuberculose.
M. bovis peut être divisé en deux sous-espèces, M. bovis subsp. bovis et M. bovis subsp. caprae. Alors que cette dernière est sensible au pyrazinamide (PZA), M. bovis subsp. bovis est résistante.

La souche vaccinale BCG, qui a été développée à partir de M. bovis, est rarement utilisée de nos jours dans la plupart des pays européens car son efficacité n'est pas claire, les effets secondaires sont fréquents et la situation épidémiologique ne nécessite pas de vaccination. Néanmoins, l'OMS recommande toujours la vaccination BCG pour les enfants de moins d'un an dans les pays à haut risque.

Un groupe hétérogène de souches que l'on trouve principalement en Afrique et qui provoque exclusivement la tuberculose chez l'homme, est appelé M. africanum. M. canettii a été principalement isolé de petits rongeurs, tandis que M. pinnipedii a été détecté chez les phoques. En de très rares occasions, ces agents pathogènes se sont révélés responsables de la tuberculose chez l'homme.

Mycobactéries non tuberculeuses

Le groupe des mycobactéries non tuberculeuses (MNT), anciennement appelées mycobactéries atypiques ou ubiquitaires, comprend plus de 150 espèces. Les MNT sont omniprésentes dans la nature et présentent une grande diversité quant à l'endroit où elles peuvent être trouvées et comment elles se sont adaptées à certaines conditions environnementales. Ils peuvent être détectés dans le sol, l'eau souterraine et l'eau potable ainsi que dans les aliments comme le lait pasteurisé ou le fromage. En général, les MNT sont moins pathogènes. Néanmoins, elles peuvent provoquer des maladies chez l'homme, en particulier chez les personnes immunodéprimées ou celles qui souffrent de maladies pulmonaires antérieures.

Le complexe M. avium (MAC) comprend les espèces M. avium et M. intracellulare qui font partie des MNT pathogènes les plus importantes et les plus fréquentes. Tout comme M. kansasii, M. malmoense et M. xenopi, ils provoquent principalement des infections pulmonaires. M. marinum est responsable d'infections de la peau et des tissus mous comme le granulome d'aquarium : voir l'article la tuberculose du poisson avec Mycobacterium marinum. En règle générale, les patients ont été en contact avec un aquarium.

Le diagnostic des MNT est souvent difficile. La décision si une infection nécessite un traitement ne peut être prise que lorsque le même agent pathogène est détecté dans différents échantillons d'un même patient.

Une mycobactérie non tuberculeuse NTM peut être cultivée sur des milieux de culture liquides et solides courants en boîte de Petri. En fonction de leur taux de croissance et de production de pigments, ils sont classés en 4 groupes (classification Runyon) :

1. Groupe I : photochromogène (souches produisant des pigments sous l'influence de la lumière), MNT à croissance lente (par exemple M. kansasii, M. marinum);
2. Groupe II : scotochromogène (souches produisant des pigments même dans l'obscurité), MNT à croissance lente (par exemple M. scrofulaceum, M. gordonae);
3. Groupe III : non chromogène (les souches ne produisent pas de pigments), MNT à croissance lente (par exemple M. avium, M. haemophilum);
4. Groupe IV : MNT à croissance rapide (par exemple M. abscessus, M. chelonae).

Actuellement, les MNT sont classées en fonction de leur taux de croissance et sont divisées en mycobactéries à croissance lente (SGM) et à croissance rapide (RGM). Elles appartiennent au groupe RGM si dans des conditions idéales elles poussent en moins de sept jours et au groupe SGM si elles ont besoin de plus de sept jours pour se développer.

Il n'existe pas de traitement standard pour le traitement des infections à MNT. La thérapie dépend toujours des espèces respectives et de ses résistances aux antibiotiques.

Au cours des dernières décennies, une augmentation du nombre d'infections à MNT a pu être observée dans le monde entier, mais en particulier dans les pays à faible prévalence de la tuberculose. Par conséquent, des diagnostics fiables constituent la base d'une thérapie réussie.

Complexe Mycobacterium leprae

La lèpre est une maladie infectieuse chronique causée par Mycobacterium leprae. La bactérie (bacille de Hansen) a été décrite pour la première fois en 1873 par le médecin norvégien Gerhard H. Armauer Hansen. En raison de son faible taux de prolifération avec une durée de génération de 10 à 14 jours, la période d'incubation peut durer plusieurs mois, voire plusieurs années. Pour être infecté, il faut être en contact étroit avec un patient. Même si le mécanisme exact de transmission n'est pas clair, une infection par gouttelettes est suspectée. Seulement 5 % de toutes les personnes peuvent développer la lèpre, le reste est génétiquement immunisé. Néanmoins, ils peuvent devenir porteurs et infecter quelqu'un d'autre.

La plupart des infections lépreuses sont sans signes pathologiques et guérissent spontanément. Selon les directives de l'OMS, la lèpre peut être divisée en lèpre paucibacillaire (tuberculoïde) et multibacillaire (lépromateuse). Le premier progresse lentement et peut être facilement traité. Cette dernière forme plus infectieuse se caractérise par une progression rapide de la maladie due à des bactéries fortement proliférantes et se manifeste par des ulcères aux mains, aux pieds, aux oreilles ou au visage.

En général, la lèpre est guérissable. Néanmoins, si la maladie est diagnostiquée trop tardivement, les voies nerveuses peuvent être endommagées de manière irréversible. Comme la lèpre peut être traitée, elle est presque éteinte dans les pays qui fournissent de bons soins de santé. En revanche, dans de nombreux pays en développement, la maladie reste un grave problème de santé. Les personnes atteintes de la lèpre sont également confrontées à des problèmes sociaux qui vont de pair avec la maladie. De plus, le traitement devient de plus en plus difficile car les résistances aux antibiotiques sont devenues de plus en plus fréquentes ces dernières années.

La lèpre est diagnostiquée en fonction des symptômes cliniques et des diagnostics de laboratoire. Malheureusement, M. leprae ne peut pas être cultivé comme les autres mycobactéries. Les tests de culture et de résistance ne réussissent que sur des modèles animaux et prennent environ un an. De plus, le diagnostic microscopique des frottis cutanés ou nasaux est souvent difficile car les échantillons sont faussement négatifs dans 70 % des cas. Par conséquent, la détection d'ADN bactérien dans les frottis cutanés par PCR est généralement la méthode de choix.

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