Zymogramme
Définition
En biochimie, un zymogramme est une technique employée pour détecter une enzyme en visualisant son activité par fluorescence. La technique associée est la zymographie pour compléter une auxanographie, principalement pour un auxanogramme du carbone en milieu de culture synthétique.
Le zymogramme d'un staphylocoque dore :
La zymographie ou zymogramme électrophorétique est une technique qui permet l'observation de l'activité enzymatique. Le zymogramme présenté concerne le staphylocoque doré Staphylococcus aureus.
Explications
La zymographie est réalisée avec un polyacrylamide et contrairement à l'électrophorèse des protéines dans des conditions dénaturantes, elle est traitée à l'aide de conditions douces (sans agents réducteurs) pour prévenir la perte d'activité des enzymes étudiées. L'activité protéase conduit à une polymérisation en présence de gélatine soluble. Ainsi, le gel obtenu contient de la gélatine, du collagène dénaturé.
Après avoir effectué l'électrophorèse, les échantillons de gélatine sont lavés dans une solution (contenant du triton X100) et incubés dans un tampon approprié qui favorise l'activité des protéases. Le résultat se situe dans la zone où une gélatine dégradée de la protéase aura démarré. Cette dégradation est révélée par coloration du gel avec des colorants qui ont une affinité pour les protéines, montrant une zone blanche où il y a dégradation.
L'activité enzymatique générique consiste à effectuer une électrophorèse en conditions natives, sans détergent ni agents réducteurs, puis, une fois la course électrophorétique du gel pré-incubé dans un tampon approprié pour l'enzyme à l'étude (sans agents dénaturants), le gel est incubé en pré-incubation similaire, mais avec le substrat tampon inclus (de préférence fluorescent) à la température optimale d'environ 37 °C. Le gel est révélé sous une lampe UV.
Le zymogramme est ensuite coloré (noir généralement avec de l'amidon ou du bleu de Coomassie), les zones où ont eu lieu l'activité enzymatique apparaissent clairement contre les zones où cette activité n'a pas eu lieu. Il est possible de développer un zymogramme ou un anti-zymogramme (par zymographie inverse), la différence entre les deux méthodes est destinée à détecter, soit l'activité d'une enzyme spécifique, soit son contraire avec un inhibiteur d'une enzyme spécifique. L'anti-zymogramme donne des zones sombres où les inhibiteurs sont exploités sur un fond clair.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "zymogramme" :
1 antonyme (sens contraire) :
- anti-zymogramme
Les mots ou les expressions apparentés à ZYMOGRAMME sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
Le mot ZYMOGRAMME est dans la page 1 des mots en Z du lexique du dictionnaire.
Mots en Z à proximité
zygotène zygotospore zymase zymodème zymogène zymogrammezymologie zymosane zymotechnie zymotique
En rapport avec "zymogramme"
Un zymodème est un groupe d'individus parasites d'une espèce ayant des isoenzymes identiques. Le motif des isoenzymes est identifié par électrophorèse.
Un zymogène est une enzyme qui ne fonctionne pas encore (proenzyme) car son action est bloquée par un emballage.
La zymologie (zymurgie) est la science, issue de l'enzymologie, de l'étude chimique de la fermentation, qui étudie le processus biochimique de la fermentation...
Le zymosane (zymosan) est un polyoside (glycane) préparé à partir de la paroi cellulaire de la levure composée de complexes protéines-glucides.