Épitope
Définition
Un épitope est un déterminant antigénique avec une structure contre laquelle des anticorps ou des récepteurs de cellules T sont formés au cours d'une réponse immunitaire adaptative. Plus spécifiquement, les épitopes sont des structures moléculaires circonscrites ou des fragments d'un antigène pouvant déclencher une réponse immunitaire spécifique.
Les épitopes de l'albumine :
Exemple de protéine à huit épitopes avec l'albumine contre laquelle huit spécificités d'anticorps différentes peuvent être formées.
Explications
L'épitope est souvent une zone de la surface d'un antigène à laquelle un anticorps ou un récepteur de lymphocytes T se lie spécifiquement. Les anticorps sont normalement dirigés contre les protéines ou les protéides. Dans de rares cas, des anticorps contre d'autres structures chimiques (par exemple, ADN, saccharides, métaux lourds, hormones stéroïdiennes, pénicilline) peuvent également être formés.
Les différentes surfaces d'un antigène pouvant être reconnu par différents anticorps (avec différentes régions complémentaires). Les molécules antigéniques, généralement de "gros" polymères biologiques, présentent souvent de nombreuses surfaces présentant des caractéristiques différentes pouvant servir de points d'interaction pour des anticorps spécifiques. Chacune de ces surfaces moléculaires distinctives constitue un déterminant antigénique ou un épitope. Par conséquent, la plupart des antigènes ont le potentiel d'être reconnus par plusieurs anticorps différents, chacun spécifique d'un épitope particulier.
La forme de l'épitope peut être imitée par un mimotope, il sera donc également reconnu par le paratope et provoquera une réponse immunitaire similaire.
Propriétés
Un seul antigène, telle qu'une protéine membranaire d'une cellule ou d'une bactérie porte différents épitopes spatiaux. Pour chacun de ces épitopes, un anticorps spécifique ou une cellule T spécifique peut être formé. Les épitopes peuvent être spécifiques à une espèce ou à un individu. Après phagocytose des antigènes par les cellules présentatrices d'antigènes, celles-ci présentent les épitopes à la surface de leurs cellules. Ceci est suivi par la réponse immunitaire adaptative.
Typiquement, les épitopes attachés aux molécules du CMH de classe I ont une longueur de 8 à 11 acides aminés, alors que les épitopes du CMH de classe II ont des chaînes peptidiques plus longues de 9 à 18 acides aminés.
On distingue les épitopes continus (épitopes à séquence synonyme) et les épitopes discontinus (épitopes conformationnels synonymes). Les protéines sont constituées de chaînes d'acides aminés et sont pliées en trois dimensions. Par exemple, les épitopes peuvent être constitués de différents résidus d'acides aminés qui sont proches les uns des autres dans l'espace, mais qui sont en réalité très éloignés dans leur séquence d'acides aminés. De tels épitopes sont appelés discontinus car ils ne sont présents qu'à l'état natif de la protéine et peuvent être reconnus. Par exemple, dans l'électrophorèse sur gel SDS et le transfert Western ultérieur, les chaînes d'acides aminés sont dépliées (dénaturées) et les anticorps ne se lient plus à des épitopes discontinus à moins que les épitopes ne soient capables de se replier sous la forme native correcte. D'autre part, les épitopes continus persistent même après la dénaturation, car ils consistent en une séquence d'acides aminés consécutifs qui est conservée pendant la dénaturation.
La spécificité de liaison d'un anticorps à son épitope est appelée affinité, tandis que la somme des énergies de liaison de tous les anticorps se liant à un antigène (à plusieurs épitopes) est appelée avidité. La zone sur le récepteur d'anticorps ou de lymphocytes T lié opposé à l'épitope sur le site de liaison est appelée paratope. Les épitopes immunodominants produisent une réponse immunitaire plus forte.
Applications
En génie génétique, les épitopes sont utilisés dans les étiquettes (par exemple, His-tag, Myc-tag, Strep-tag, V5-tag ou Flash-tag) pour permettre à une protéine de fusion de détecter des protéines pour lesquelles aucun anticorps approprié n'est disponible. se tient. À cette fin, le gène d'un épitope est incorporé dans le même cadre de lecture que la protéine à examiner, de sorte que la protéine exprimée reçoive un marqueur épitope N ou C-terminal. Un anticorps peut maintenant être utilisé pour la détection contre l'épitope attaché. Le même épitope peut être lié de manière répétée à de nouvelles protéines dans différentes expériences. Ainsi, le même anticorps peut toujours être utilisé, ce qui représente un effort et des économies de coûts considérables.
La base de données immunitaire d'épitopes est une base de données en ligne sur les épitopes déjà décrits, ainsi que sur des programmes permettant de prédire l'affinité de liaison des épitopes aux molécules du CMH (immunologie inverse). L'étude systématique des épitopes dans un antigène est appelée cartographie des épitopes.
Biochimie
Les anticorps, libres ou fixés à la matrice extracellulaire, se lient à des molécules antigéniques sur une surface de liaison, formant ainsi des complexes antigène-anticorps. Ces surfaces de liaison sur les macromolécules sont constituées de séquences spécifiques complexes appelées déterminants antigéniques ou épitopes. La plupart des épitopes reconnus par des anticorps ou des cellules B peuvent être considérés comme des reliefs des surfaces tridimensionnelles d'une molécule d'antigène; Ces reliefs s'adaptent parfaitement et se lient donc aux anticorps. La partie d'un anticorps qui reconnaît l'épitope s'appelle un paratope. L'exception concerne les épitopes linéaires, qui sont déterminés par la séquence d'acides aminés (la structure primaire) plutôt que par la forme 3D (structure tertiaire) d'une protéine.
Si la séquence génétique d'un certain épitope qui sera reconnu par un anticorps est connue, il est possible de l'utiliser pour générer une protéine chimère par fusion du cadre de lecture ouvert (ORF) d'un gène à étudier avec la séquence dudit épitope; de cette manière, l'anticorps initial peut être utilisé pour détecter la protéine chimère, ce qui permet de la détecter et de l'analyser. Cette stratégie a été utilisée pour caractériser c-myc, HA, FLAG et V5.
Immunologie
Dans les cellules T, les épitopes sont présentés à la surface d'une cellule présentant l'antigène, plus précisément par l'intermédiaire des molécules du CMH. Les épitopes de lymphocytes T présentés par les molécules du CMH de classe I sont généralement des peptides d'une longueur comprise entre 8 et 15 acides aminés, alors que les molécules du CMH de classe II ont des peptides plus longs et que les molécules du CMH non classiques possèdent également des épitopes non peptidiques tels que les glycolipides.
Les épitopes peuvent être tracés en utilisant des puces à protéines, et avec les techniques ELISPOT ou ELISA.
Les épitopes ont parfois une réactivité croisée. Cette propriété est exploitée par le système immunitaire dans la régulation par des anticorps anti-idiotypes (nom proposé à l'origine par le lauréat du prix Nobel Niels Kai Jerne). Si un anticorps se lie à un épitope d'un antigène, le paratope peut convertir l'épitope en un autre anticorps qui se liera ensuite à celui-ci. Si ce second anticorps est de classe IgM, sa liaison peut accentuer la réponse immunitaire; si le deuxième anticorps est de classe IgG, sa liaison peut la diminuer.
Des recherches intensives sont en cours pour concevoir des outils fiables permettant de prédire les épitopes de protéines. Voir aussi les allotypes.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "épitope" :
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à ÉPITOPE sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
Le mot EPITOPE est dans la page 4 des mots en E du lexique du dictionnaire.
Mots en E à proximité
épithélialisation épithélio-musculaire épithélium épithèque épithète épitopeépitoque épitoquie épivalve épizoïque épizoïsme
En rapport avec "épitope"
Un antigène T est situé dans le noyau d'une cellule tumorale transformée par un virus.
Un déterminant antigénique, ou un épitope, est une région d'un antigène qui possède des propriétés antigéniques et qui constitue le site de fixation...
Un lymphocyte T (cellule T) est un lymphocyte produit dans la moelle osseuse puis se développe dans le thymus (T), dont les fonctions sont une partie...
La réponse immunitaire est l'ensemble des mécanismes de réponse (défense) mis en place par le système immunitaire des organismes supérieurs entrant en contact...