Auxotrophie
Définition
L'auxotrophie est un mode trophique qui caractérise des organismes, autotrophes pour la très grande majorité, mais qui ne peuvent pas synthétiser certaines molécules qui leur sont indispensables (ex. : des vitamines). Ces organismes auxotrophes sont donc hétérotrophes pour ces quelques composés.
L'auxotrophie est l'incapacité d'un organisme à synthétiser un composé organique particulier nécessaire à sa croissance.
L'auxotrophie d'une souche bactérienne :
Schéma de l'auxotrophie de la souche bactérienne et restauration de la croissance prototrophe par l'ADN plasmidique.
Explications
Par exemple, chez les staphylocoques, les auxotrophies fréquentes généralement observées dans les SCV sont basées sur un mécanisme majeur de déficiences dans le transport des électrons (auxotrophes de la ménadione et de l'hémine).
L'auxotrophie est définie comme l'incapacité d'un organisme à synthétiser un composé organique particulier nécessaire à sa croissance. Pour produire un plasmide sans antibiotique en utilisant cette stratégie, la souche bactérienne est d'abord modifiée en introduisant une délétion ou une mutation ponctuelle non-sens dans un gène chromosomique essentiel ou conditionnellement essentiel entraînant une auxotrophie. La croissance bactérienne est restaurée lors de l'introduction dans ces souches d'un plasmide portant le gène délété ou codant un ARNt suppresseur qui permet une traduction complète de la protéine tronquée.
Plusieurs gènes cibles ont été étudiés ces dernières années et les stratégies développées ont montré des résultats prometteurs. L'auxotrophie de la glycine a été obtenue après disruption chromosomique du gène glyA qui code pour la sérine hydroxyméthyl transférase qui est impliquée dans la principale voie de biosynthèse de la glycine chez Escherichia coli E. coli. La souche mutante résultante ne peut croître rapidement que si de la glycine est ajoutée au milieu de culture. Un plasmide de complémentation avec une copie fonctionnelle du gène glyA a été construit fournissant une source de sérine hydroxyméthyl transférase et permettant ainsi la croissance de la souche bactérienne auxotrophe. Des constructions plasmidiques basées sur ce squelette pourraient donc être sélectionnées et maintenues en culture sans addition d'antibiotiques.
Les auxotrophes sont couramment utilisés dans la transformation des champignons filamenteux, qui nécessite un gène, ou le marqueur sélectionnable, qui restaure la prototrophie. Cependant, le goulot d'étranglement de l'utilisation de l'auxotrophie comme marqueur sélectionnable est qu'une souche mutante de départ est nécessaire. Pour les champignons filamenteux modèles bien étudiés N. crassa et A. nidulans, et le champignon filamenteux bien connu et important sur le plan industriel T. reesei, certains marqueurs nutritionnels sont disponibles, notamment pyrG et argB.
Synonymes, antonymes
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Mots en A à proximité
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En rapport avec "auxotrophie"
Un auxotrophe qualifie un organisme (micro-organisme, moisissure) auquel il faut fournir un facteur de croissance qu'il ne peut plus synthétiser.
L'autotrophie est le mode trophique d'un organisme capable de synthétiser de la matière organique à partir de matière minérale.
La caecotrophie (ou cécotrophie) consiste en une ingestion de pelotes stercorales ou cæcotrophes, sorte de crottes molles, humides entourées de mucus.
L'hétérotrophie est un mode trophique (nutrition hétérotrophe) qui caractérise les organismes assurant leur subsistance en assimilant des substances...