Marqueur génétique

Définition

En cartographie génétique, un marqueur génétique définit une séquence d'ADN particulière utilisée pour baliser les chromosomes. Ce marqueur moléculaire est un segment d'ADN ayant un emplacement physique identifiable (locus) sur un chromosome et dont le patrimoine génétique peut être tracé.

Des marqueurs génétiques moléculaires :

empreinte peptidique. Les extraits protéiques des échantillons sont soumis à une électrophorèse sur gel d'agarose, avec une coloration supplémentaire par l'activité isozyme. L'exemple de gauche montre un marqueur génétique dominant avec un allèle nul à des fins descriptives ; celui de droite montre un marqueur génétique codominant (l'hétérozygote est expliqué car l'enzyme est un dimère).

Explications

Un marqueur peut être un gène ou une section d'ADN sans fonction connue. Étant donné que les segments d'ADN contigus sur un chromosome tendent à être hérités ensemble, les marqueurs sont souvent utilisés comme moyens indirects de suivre le schéma d'héritage d'un gène qui n'a pas encore été identifié, mais dont l'emplacement approximatif est connu. Les marqueurs sont utilisés pour la cartographie génétique en tant que première étape dans la recherche de la position et de l'identité d'un gène.

Les premiers marqueurs connus étaient des allozymes. Ils sont largement utilisés en génétique humaine, végétale, animale et microbienne. Ils permettent de montrer des variations (polymorphismes) de la séquence d'ADN entre deux individus, de modifier ou non leur phénotype. Ils fonctionnent comme des marqueurs pour différentes régions du génome.

Au cours du contrôle du transfert de gène : gène associé au gène d'intérêt, codant une caractéristique détectable facilement et précocement, facilitant le repérage des cellules au sein desquelles la transgenèse a réussi. La détection d'un marqueur génétique peut s'effectuer par hybridation avec une sonde complémentaire, ou par son expression phénotypique.

Les types de marqueurs génétiques sont :

• à base de protéines :
  • des isoenzymes;
  • des protéines de réserve.
• basés sur l'ADN :
  • RFLP (ou polymorphisme dans la longueur des fragments de restriction);
  • AFLP (ou polymorphisme de longueur de fragment amplifié);
  • RAPD (ou amplification aléatoire de l'ADN polymorphe);
  • VNTR (ou nombre variable de répétitions en tandem);
  • microsatellites, SSR ou STR;
  • SNP (ou polymorphisme mononucléotidique);
  • SFP (ou polymorphisme à une seule caractéristique);
  • TRAP (ou polymorphismes pour l'amplification des régions blanches).

Voir aussi l'horloge moléculaire.

En biologie moléculaire, le terme marqueur fait référence à de courtes coupes d'ADN clairement identifiables, dont l'emplacement est connu dans le génome; par exemple : SNP (polymorphisme nucléotidique simple).

⭐ Ces gènes marqueurs sont présents dans le génome avec différents types de marqueurs. Cependant, les gènes marqueurs peuvent également être incorporés génétiquement. Ces gènes rapporteurs sont choisis pour que leur présence dans un organisme soit facilement reconnaissable.

Par exemple, des gènes pour des protéines fluorescentes ou des enzymes rapporteurs sont ajoutés à un micro - organisme avec d'autres gènes, moins facilement reconnaissables. Ceux de ses descendants qui ont hérité de la séquence du gène peuvent être reconnus, par exemple, par le fait qu'ils fluorescent. Ils sont donc très susceptibles d'avoir hérité des gènes qui sont à côté du gène marqueur dans la séquence génétique ajoutée.

Les gènes qui confèrent une résistance ou fixent l'auxotrophie sont appelés marqueurs de sélection. Les gènes marqueurs qui affectent le phénotype sont appelés marqueurs marquables.

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