Locus

Définition

En génétique, un locus désigne la localisation, un emplacement précis, une position fixe, d'un gène particulier ou d'un marqueur génétique (ensemble de nucléotides) sur un chromosome dans le génome. Une variante de la séquence d'ADN similaire située à un locus donné est appelé un allèle.

En biologie, et par extension, en calcul évolutif, le locus est utilisé pour identifier des positions d'intérêt sur certaines séquences. La liste ordonnée de loci (pluriel de locus) connus pour un génome particulier est appelée carte génétique, tandis que le processus de détermination du lieu d'un caractère biologique donné est appelé cartographie génétique.

Un chromatide et des locus :

Les locus d'une chromosome signalent un chromatide (une des deux parties identiques du chromosome après la phase S), un centromère (point où les deux chromatides entrent en contact et où se rejoignent les microtubules), et les bras courts et longs.

Explications

Les cellules diploïdes et polyploïdes dont les chromosomes ont le même allèle d'un gène donné à un locus sont appelés homozygotes par rapport à ce gène, alors que ceux qui ont des allèles d'un gène donné en un locus différent, sont appelés hétérozygotes par rapport à ce gène.

⭐ Si le génome est composé de plusieurs chromosomes, le locus du gène est l'emplacement sur le chromosome où se trouve le gène. Différentes formes ou variantes de ce gène sont également appelées allèles attribués au même locus. Le terme provient de la création des premières cartes génétiques et est lié à la reconnaissance du fait que les gènes ont des emplacements spécifiques dans l'arrangement des chromosomes.

En nomenclature, le locus chromosomique d'un gène pourrait être annoté, par exemple, sous la forme "22p11.2". Une plage d'emplacements est spécifiée de la même manière. Par exemple, le locus du gène OCA1 serait étiqueté "11q1.4-q2.1", ce qui signifie qu'il se trouve sur le bras long du chromosome 11, quelque part dans la sous-bande 4 de la bande 1.

✅ Les extrémités d'un chromosome sont étiquetées "pter" et "qter", ainsi "2qter" désigne le télomère du bras long du chromosome 2. Les bandes cytogénétiques comptent à partir du centromère vers les télomères.

Plus complètement, pour nommer un locus, on appelle d'abord le numéro du chromosome, puis on identifie le bras du chromosome par rapport au centromère - soit par la lettre p pour le plus court (une explication apocryphe commune est que le p signifie petit en français); q) ou par q pour le bras plus long ((choisi comme lettre suivante de l'alphabet après p; alternativement, il est parfois dit que q signifie queue en français) - et donne enfin, la région chromosomique de ce bras est plus précisément numérotée pour la bande et la sous-bande, cette dernière étant séparée par un point.

Cette nomenclature ne donne aucune indication sur la fonction du gène - contrairement à des noms tels que le gène Hox ou MYH9 - et décrit simplement l'emplacement. Par exemple, on peut dire que le gène MYH9 pour la protéine myosine-9 (chaîne lourde 9 non musculaire ou MYH9) chez l'homme est au locus génique 22q12.3 ou 22q13.1. Ou encore, une maladie provoquée par une délétion partielle au locus 1q21.1 peut être appelée syndrome de délétion 1q21.1.

✅ Un centisome (à ne pas confondre avec un centrosome) est défini à 1 % de la longueur d'un chromosome.

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