Microbiome

Définition

Le microbiome est le matériel génétique de tous les microbes - bactéries, champignons, protozoaires et virus - qui vivent sur et à l'intérieur d'un petite zone. Le microbion est particulièrement étudié, par exemple celui du sol pour les facteurs édaphiques. Le microbiome du corps humain est extrêmement important pour la santé. Le nombre de gènes de tous les microbes du microbiome d'une personne est 200 fois supérieur au nombre de gènes du génome humain.

Un microbiome :

Le microbiome peut peser jusqu'à plus de 1 kilogramme. L'existence du microbiome n'a été généralement reconnue qu'à la fin des années 1990.

Explications

Un microbiome est constitué de l'ensemble des microbes d'un organisme ou d'un sol, de leurs éléments génétiques (génome), et des interactions environnementales. Le microbiome est parfois défini comme un biome microbiotique, à l'inverse d'un biome, macrobiome, zonobiome, orobiome ou pédobiome.

Le terme et la définition de "microbiome" ont été inventés par Joshua Lederberg, qui a fait valoir que les micro-organismes vivant dans le corps humain doivent être inclus dans le cadre du génome humain en raison de leur influence sur la physiologie humaine. Le corps humain contient plus de 10 fois plus de cellules microbiennes que de cellules humaines, bien que l'ensemble du microbiome ne pèse que 200 grammes (estimation basse) à 1 400 grammes (estimation haute).

Les bactéries présentes dans le microbiome aident à digérer nos aliments (flore intestinale), régulent notre système immunitaire, protègent contre d'autres bactéries qui causent des maladies et produisent des vitamines, notamment les vitamines B B12, la thiamine et la riboflavine, et la vitamine K, qui est nécessaire à la coagulation sanguine.

Microbiomes d'écotypes

Les microbiomes sont caractérisés dans de nombreux autres environnements, ainsi, y compris dans le sol, dans l'eau de mer et dans l'eau douce. Il a été suggéré que les microbes ont eu une relation de symbiose avec d'autres organismes depuis l'émergence des créatures complexes sur Terre.

Les facteurs écologiques abiotiques comme les facteurs édaphiques sont fondamentaux pour certaines sciences comme l'agriculture.

Déterminer les connaissances existantes sur les facteurs abiotiques les plus importants influençant les micro-organismes du sol montre l'importance des recherches modernes dans l'identification de la biodiversité microbiologique du sol.

Une bonne symbiose

🚩 Afin d'éviter toute confusion, il convient de noter que les microbes et microbiontes (archées, bactéries, protistes) en cours de discussion sont généralement non pathogènes et ne provoquent pas de maladie à moins qu'ils ne se développent anormalement. Le microbiome vit en harmonie et en symbiose avec son hôte.

Certains chercheurs ont appris qu'une grande partie de la population de microbes trouvés dans le corps humain ne sont pas les bactéries, mais une classe de très vieux organismes unicellulaires appelés archéobactéries.

Un environnement indispensable et déterminant

Le microbiome est essentiel pour le développement humain, l'immunité et la nutrition. Les bactéries qui vivent en nous et sur nous ne sont pas des envahisseurs mais des colonisateurs bénéfiques. Les maladies auto-immunes telles que le diabète, la polyarthrite rhumatoïde, la dystrophie musculaire, la sclérose en plaques et la fibromyalgie sont associées à un dysfonctionnement du microbiome. Les microbes pathogènes s'accumulent au fil du temps, modifiant l'activité des gènes et les processus métaboliques et entraînant une réponse immunitaire anormale contre les substances et les tissus normalement présents dans le corps. Les maladies auto-immunes semblent être transmises dans les familles non pas par héritage de l'ADN, mais par héritage du microbiome de la famille.

⭐ Le microbiome d'une personne peut influencer sa sensibilité aux maladies infectieuses et contribuer aux maladies chroniques du système gastro-intestinal comme la maladie de Crohn et syndrome du côlon irritable. Quelques collections de microbes déterminer comment une personne réagit à un traitement médicamenteux. Le microbiome de la mère peut affecter sa santé les enfants.

Les chercheurs cartographiant le microbiome humain sont découvrir des espèces et des gènes jusqu'alors inconnus. Des études génétiques qui mesurent l'abondance relative de différentes espèces du microbiome humain ont lié diverses combinaisons d'espèces microbiennes à certains humains conditions de santé. Une compréhension plus complète de la diversité des microbes dans le microbiome humain pourraient conduire à de thérapies, peut-être pour traiter une infection bactérienne causée par une "mauvaise" bactérie en cultivant plus de "bonnes" bactéries.

L'obésité commune peut être aggravée par un mauvais microbiome avec une mauvaises combinaison de la flore intestinale, un assortiment mal conçu de microbes dans l'intestin.

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