Transposon
Définition
En génétique, un transposon est un petit segment d'ADN capable de se déplacer d'une région de la molécule d'ADN à une autre région. Cet élément génétique transposable est une séquence d'ADN pouvant se déplacer de manière autonome vers différentes parties du génome d'une cellule, phénomène appelé transposition.
Le transposon dans une une transposition :
Dans une transposition de classe I, le transposon se déplace directement d'une position à une autre du génome en utilisant une transposase pour couper et coller.
Le transposon est ce fragment d'ADN qui est capable de se déplacer d'un locus génétique à un autre, directement d'une position à une autre du génome en utilisant une transposase pour couper et coller, provoquant une recombinaison. Lorsqu'il s'intègre dans un gène, ce dernier peut devenir inactif. Une recombinaison génétique peut intervenir.
Dans ce processus, des mutations et un changement de la quantité d'ADN dans le génome peuvent être provoqués. Ils étaient auparavant connus sous le nom de gènes sauteurs et sont des exemples d'éléments génétiques mobiles.
Processus de transposition
Le transposon modifie l'ADN de son environnement, soit en faisant glisser un gène codant pour un chromosome, en le brisant en deux ou en le faisant disparaître complètement. Chez certaines espèces, la majeure partie de l'ADN (jusqu'à 50 % du génome total) correspond à des transposons. Ces éléments mobiles ont accompagné les organismes vivants au cours de leur évolution, contribuant de manière décisive aux changements génétiques.
Contrairement aux provirus, les transposons s'intègrent à l'ADN cellulaire à des emplacements bien définis. Barbara McClintock a proposé son existence dans le maïs, mais sa présence n'a été démontrée que bien plus tard dans les bactéries. Pour cette raison, il reçut le prix Nobel en 1983.
Ce sont des gènes mobiles qui n'ont pas de capacité de réplication et dépendent de l'intégration dans la cellule hôte. En principe, ils ne sont pas infectieux, mais ils se comportent comme des parasites intracellulaires. Barbara McClintock les a découvertes dans le maïs et les a appelées "éléments de contrôle" car elles pourraient modifier l'expression des gènes dans lesquels elles sont insérées. Plusieurs familles de transposons ont été décrites et sont regroupées en deux classes, I et II. Ceux de classe I sont mobilisés à travers l'ARN (rétrotransposons), sont les plus connus. La classe II saute directement à travers l'ADN. Le nombre de copies de chaque famille varie selon les espèces et les individus. Il n'a aucune spécificité dans son site d'intégration du génome. Ils sont mobilisés au hasard et peuvent entrer dans des introns, des exons ou des gènes régulateurs. Ensuite, ils provoquent des mutations et augmentent la variabilité génétique. En ce sens, ils constituent un moteur d'évolution clair.
Classification des transposons
Il existe une grande diversité d'éléments génétiques mobiles, les transposons, et peuvent être classés en fonction de leur contenu, de leur stratégie et de leur mécanisme de transposition.
Selon le contenu :
- Transposon simple, séquence d'insertion ou élément d'insertion (IS) : ils contiennent une séquence centrale avec des informations pour la transposase, une enzyme nécessaire à la transposition et, aux extrémités, une séquence répétée dans l'ordre inverse. Cette séquence répétée dans l'ordre inverse n'est pas forcément identique bien que très similaire. Lorsqu'un simple transposon est intégré à un certain point de l'ADN, une répétition directe de la séquence cible apparaît (5 à 12 pb).
- Transposon composite (Tn) : ils contiennent un élément d'insertion (IS) à chaque extrémité en ordre direct ou inverse et une région centrale avec la transposase qui contient également des informations d'un autre type. Par exemple, les facteurs de transfert de résistance (RTF) contiennent des informations dans la zone centrale sur la résistance aux antibiotiques tels que le chloramphénicol, la kanamycine, la tétracycline, ce qui confère un avantage sélectif aux bactéries qui en sont atteintes.
Transposons chez les vertébrés
En 2009, le transposon hAT a été trouvé chez sept espèces d'animaux taxonomiquement si éloignées que certaines divergeaient il y a 340 millions d'années. Entre autres, le hérisson commun Erinaceus europaeus, le tenrec commun Tenrec ecaudatus, le possum américain, la sauterelle et une espèce de grenouille.
La chose la plus frappante dans cette étude est la découverte de séquences génomiques similaires entre le hérisson et le tenrec, des animaux similaires mais non apparentés. L'éléphant ne présente pas ce transposon bien qu'il soit plus proche taxonomiquement du tenrec (Afrotheria).
La position de ce transposon dans le génome varie entre les différentes espèces, ce qui suggère une transmission horizontale (les informations passent d'une espèce à une autre) et non verticale (la séquence passe des parents aux descendants).
Synonymes, antonymes
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En rapport avec "transposon"
L'activité transcriptase au sein d'un virion assemblé catalyse la synthèse de l'ARN à brin positif descendant à partir de la matrice d'ARN double brin...
La transcriptase inverse, également appelée rétrotranscriptase et ADN polymérase ARN-dépendante, est une ADN polymérase qui transcrit l'ARN simple brin en ADN.
La rétrotransposition implique la transcription d'un élément, la transcription inverse de la copie d'ARN en un ADNc par une transcriptase inverse codée...
Un rétrotransposon est un transposon dont la séquence présente une homologie avec celle d'un rétrovirus.