Allophycocyanine
Définition
Une allophycocyanine est un pigment protéinique bleu turquoise appartenant à la famille des phycobiliprotéines, impliqué dans la photosynthèse des cyanobactéries et des algues rouges Rhodophytes et fait partie des phycobilines (phycocyanobilines). C'est un pigment accessoire à la chlorophylle, récoltant la lumière, ainsi que de la phycocyanine, phycoérythrine et phycoérythrocyanine.
Cette protéine a une masse moléculaire d'environ 80 kDa. Couplé à un anticorps, l'allophycocyanine est l'un des colorants fluorescents les plus brillants utilisés dans les analyses par cytométrie en flux. Elle est également utilisée pour détecter des antigènes spécifiques par microscopie à fluorescence. Le pigment est excité par un laser HeNe à 633 nm et émet de la lumière d'une longueur d'onde de 680 nm.
L'allophycocyanine (et ses phycocyanobilines) d'une cyanobactérie :
Vue de la structure de l'allophycocyanine dodécamère (polymère) et des 12 phycocyanobilines (vert) de la cyanobactérie Gloeobacter violaceus, qui a la particularité de ne pas posséder de thylacoïdes. G. violaceus produit plusieurs pigments, notamment la chlorophylle a, le β-carotène, le diglycoside oscillique et l'échinénone. La coloration pourpre est due à la teneur relativement faible en chlorophylle. La croissance cesse dans l'obscurité totale, de sorte que Gloeobacter est très probablement photoautotrophe obligatoire. Gloeobacter aurait pu se séparer des autres cyanobactéries entre 3,7 et 3,2 milliards d'années.
Explications
Toutes les phycobiliprotéines sont solubles dans l'eau et ne peuvent donc pas exister au sein de la membrane comme les caroténoïdes, mais forment des agrégats formant des agrégats qui adhèrent à la membrane, appelés phycobilisomes. L'allophycocyanine absorbe et émet de la lumière rouge (650 et 660 nm max, respectivement). Elle se trouve facilement dans les cyanobactéries (également appelées algues bleu-vert) et les algues rouges.
Les pigments de phycobiline ont des propriétés fluorescentes qui sont utilisées dans les kits de dosage immunologique.
L'allophycocyanine peut être isolée à partir de différentes espèces d'algues rouges ou bleu-vert, chacune produisant des formes légèrement différentes de la molécule. Elle est composée de deux sous-unités différentes (α et β) dans lesquelles chaque sous-unité possède un chromophore de phycocyanobiline (PCB). La structure des sous-unités pour cytométrie en flux a été déterminée comme étant (αβ)3.
Voir aussi d'autres cyanines : anthocyanine, hémicyanine, hémocyanine, indocyanine, phthalocyanine, streptocyanine.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "allophycocyanine" :
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