Laminarine
Définition
Une laminarine est un polymère hydrosoluble du glucose (glucane beta1,3 ramifié en beta1,6) utilisé comme substance de réserve vacuolaire par les algues brunes (laminaires Phéophycées), différant de la chrysolaminarine par la présence de mannitol à l'extrémité de certaines chaînes. Voir aussi une laminarane (et une chrysolaminarane).
Par exemple, il y a reconnaissance moléculaire des bêta-glucanes laminarine et pustulane par une protéine de liaison au glycane de type SusD d'une bactérie du phyllum marin Bacteroidetes.
Une laminarine :
La structure tridimensionnelle de la protéine GMSusD de la laminarine de bactéries Bacteroidetes. (A) Vue d'ensemble de la structure de la protéine GMSusD représentée comme une couleur de dessin animé en rampe du bleu (extrémité N) au rouge (extrémité C). (B) Comparaison de la structure de GMSusD en gris, avec la structure 3D de la protéine de liaison d'origine SusD (code PDB 3CK8) de l'amidon. (C) Le site de liaison de GMSusD contient trois résidus tryptophane en bleu foncé, qui sont situés à la surface de la protéine. (D) Zoom de l'affichage de surface du site de liaison du glycane et les positions des résidus tryptophane de GMSusD (bleu foncé). L'expérience de mutagenèse dirigée a confirmé l'importance de chacun des trois résidus tryptophane; trois étoiles indiquent l'impact le plus élevé pour la liaison au polysaccharide.
Explications
Les bactéries marines catabolisent les polymères glucidiques des algues, qui synthétisent ces molécules structurellement diverses dans les eaux de surface des océans. Bien que les glycanes d'algues soient une source abondante de carbone et d'énergie dans l'océan, les détails moléculaires qui permettent une reconnaissance spécifique entre les glycanes d'algues et les dégradateurs bactériens restent largement inconnus. Ici, une protéine de surface (GMSusD) issue du plancton Bacteroidetes Gramella sp. se développe pendant les proliférations d'algues. Les analyses biochimiques et structurales montrent que GMSusD lie des polysaccharides de glucose tels que la laminarine ramifiée et le pustulane linéaire.
La structure cristalline de 1,8 Å de GMSusD indique que trois résidus tryptophane forment le site putatif de liaison au glycane. Les études de mutagenèse ont confirmé que ces résidus sont cruciaux pour la reconnaissance de la laminarine. Nous avons interrogé les métagénomes des ensembles de données globales sur les eaux de surface pour la présence de protéines de type SusD et avons trouvé des séquences avec les trois résidus structurellement conservés à différents endroits dans l'océan. La sélectivité moléculaire de GMSusD souligne que des interactions spécifiques sont nécessaires pour la reconnaissance de la laminarine. En conclusion, nos résultats fournissent un aperçu des détails moléculaires de la liaison du β-glucane par GMSusD et notre analyse bioinformatique révèle que cette interaction moléculaire peut contribuer au cycle du glucane dans l'océan de surface.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "laminarine" :
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à LAMINARINE sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
Le mot LAMINARINE est dans la page 1 des mots en L du lexique du dictionnaire.
Mots en L à proximité
lamina propria laminage de crue laminaire laminallaminarane laminarinelaminine Lamniformes lampe à carbure lamproie lampyre
En rapport avec "laminarine"
Le chrysolaminarane est admis comme un polysaccharide composé d'unités de glucose trouvées dans les algues hétérocontées.
La chrysolaminarine est un polymère hydrosoluble du glucose (glucane β1,3 ramifié en β1,6) utilisé comme substance de réserve vacuolaire...
Pour laminarane, voir la laminarine qu'il est préférable d'employer car elle ne laisse pas supposer qu'il s'agit d'un polymère du laminarose, un composé...
La lamina nucléaire est un réseau réticulé de filaments intermédiaires de 10 à 20–80 nm d'épaisseur qui tapisse la membrane nucléaire interne, comme...