Phénétique

Définition

Une classification phénétique est une méthode d'établissement des relations de parenté basé sur le nombre de caractères communs partagés par des organismes ou des molécules, indépendamment de toute notion d'homologie : plus ce nombre de caractères communs est important et plus l'ancêtre commun est récent. Les relations de parenté sont donc précisées à partir d'une matrice des distances.

Voir aussi la phylogénie. Aujourd'hui, la phénétique a presque complètement été remplacée par la cladistique !

Les différences de classifications phénétique et cladistique des Citharinidae :

Les méthodes phénétiques (comme avec les cladistiques) produisent des phénogrammes et des phylogrammes. Une analyse taxonomique phénétique met l'accent sur les similitudes globales des caractéristiques entre les taxons biologiques sans égard aux relations phylogénétiques.

Explications

La taxonomie numérique ou phénétique est un système de classification en classification biologique. L'objectif est d'établir une taxonomie biologique basée sur des caractéristiques morphologiques. Ce faisant, on utilise beaucoup les méthodes de calcul assistées par ordinateur et en particulier l'analyse par grappes. Le concept de taxonomie numérique a été développé en 1961 par Robert R. Sokal et Peter Sneath (1923–2011) dans le livre Principles of Numerical Taxonomy.

Motivation et pratique

L'orientation morphologique de la phénétique était en cours de développement contrairement à la majorité de la théorie et de la pratique taxonomiques. La majeure partie de la classification biologique est basée sur le développement phylogénétique. L'omission de considérations théoriques sur l'évolution est explicitement souhaitée par Sokal et Sneath. L'objectif est de développer un système taxonomique universel aussi dépourvu de théorie que possible et qui soit également contraignant pour les diverses disciplines telles que l'écologie, la biologie évolutive ou la paléontologie.

La phénétique repose sur un grand nombre de caractéristiques morphologiques, qui doivent toutes être observables et quantifiables. Au cours du processus, la mesure dans laquelle les caractéristiques leur sont attribuées est déterminée pour les individus. Au moyen de procédures complexes assistées par ordinateur, il convient de trouver une mesure objective de la similarité des individus. Les similitudes peuvent alors servir de matériau pour un système taxonomique.

⭐ Voir aussi le phénotype et le génotype.

Critique et inclusion dans la recherche

La phénétique n'a pas pu prévaloir dans la classification biologique. D'une part, les biologistes de l'évolution rejettent une taxonomie purement morphologique comme irréaliste. D'autre part, il existe de sérieuses objections théoriques scientifiques à la conception phénétique d'une taxonomie objective. En raison de la sélection et de la pondération nécessaires des caractéristiques morphologiques, les concepts d'espèce morphologique sont en partie subjectifs et souvent guidés par la méthodologie disponible et les intérêts de recherche spécifiques. Deuxièmement, la majorité des taxonomistes estiment aujourd'hui que la taxonomie devrait être alignée sur des critères phylogénétiques. Puisque les algorithmes de cluster utilisés dans la taxonomie numérique ne font pas la distinction entre les caractéristiques convergentes et homologues, ils ne donnent pas toujours une reconstruction correcte des processus phylogénétiques (évolutifs). L'évolution convergente influence souvent de nombreuses caractéristiques morphologiques communes (par exemple, la comparaison des oiseaux et des chauves-souris), de sorte qu'une évaluation purement quantitative trompe.

Les problèmes de taxonomie numérique, cependant, ne changent pas le fait qu'elle est utilisée avec succès dans certains domaines. Ceci s'applique en particulier aux zones dans lesquelles d'autres concepts d'espèce ne sont pas applicables. C'est, par exemple, en paléontologie, le cas où le concept biologique d'espèce Ernst Mayrs ne peut souvent pas être utilisé, puisque habituellement aucune information sur les options de reproduction n'est disponible.

L'affirmation selon laquelle une méthode taxonomique généralement acceptée a été présentée peut être considérée comme un échec. Cependant, cela n'exclut pas que la phénétique puisse avoir une place permanente dans plusieurs systèmes taxonomiques.

Différences avec la cladistique

Les études phénétiques ne distinguent pas les plésiomorphes (anciens, donc, phylogénétiquement non pertinents) des apomorphes (ceux nouvellement développés). Par conséquent, les études taxonomiques numériques peuvent être mal comprises par le phénomène d'évolution convergente ou de rayonnement adaptatif. Un défaut typique dans l'enquête phénotypique est que monophylétique montre les étapes évolutives de base, qui ont de nombreuses caractéristiques pléomorphes par rapport aux lignes d'origine plus avancées.

Considérons, par exemple, les moineaux. Ils se divisent en deux groupes : l'un est Corvida, qui présente des phénotypes anciens et des caractéristiques génotypiques, l'autre est Passerida avec des caractéristiques plus modernes. Mais seul ce dernier contient des taxa étroitement apparentés; la première comprend de nombreuses lignées d'origine ancestrales indépendantes qui correspondent approximativement à la même distance d'évolution que les taxons Passerida. Une analyse purement phénotypique du groupe Corvida montrerait une mono-phylogénie en raison de leur similitude générale, bien que leurs caractéristiques communes soient présentes dans tous les ancêtres de la moelle épinière. C'est donc précisément la perte de ces caractéristiques anciennes qui indiquera quels groupes de moineaux sont les plus proches les uns des autres.

La taxonomie phénétique et la taxonomie numérique ne sont bien sûr pas des méthodologies mutuellement exclusives. De nos jours, on considère que la phénétique fournit trop d'informations fausses sur les relations évolutives, de sorte qu'elle est exclue du système traditionnel. Mais il n'existe aucun obstacle pour que les espèces séparées par taxonomie numérique soient analysées ultérieurement par cladistique afin de déterminer l'emplacement de l'arbre évolutif. Les méthodes phénétiques peuvent également bénéficier si la différence entre les taxons est essentielle, car la méthode de calcul est plus basse. Si, toutefois, des informations sur l'histoire évolutive d'un taxon sont nécessaires, les scientifiques se concentrent maintenant sur les méthodes catholiques.

Phénétique en linguistique

Suivant l'exemple de Sokal/Sneath, des classifications ont également été réalisées en linguistique dans divers domaines. Ici aussi, l'objectif est d'utiliser des méthodes de classification aussi objectives que possible. Appliquées aux questions de typologie linguistique, les propriétés morphologiques et syntaxiques des langues produisaient des résultats qui coïncidaient dans une large mesure avec les classifications historiques. D'autres expériences de classification sont basées sur les propriétés de distribution des phonèmes des langues.

Phénéticisme

Le phénéticisme est une forme de taxonomie numérique, venant compléter les autres écoles de taxonomie avec le cladisme et l'évolutionnisme. Dans la classification et la systématique, la seule chose qui intéresse les phénéticistes concerne la "distance phénétique".

Le phylogramme est donc simplifié en phénogramme, lequel comporte des phénons. A partir de ce phénogramme fabriqué par les phénéticistes qui acceptent les groupes polyphylétiques, ignorant tout simplement la généalogie, ou plutôt la topologie.

A l'opposé, les cladistes exploitent un phylogramme épuré afin de ne conserver que la topologie aboutissant à un cladogramme. Le cladogramme comporte des clades groupés par holophylie. La philosophie du cladisme, pour composer la classification, consiste à transposer automatiquement tous les clades en taxons.

Les évolutionnistes ne veulent pas simplifier le phylogramme pour constituer la systématique, tenant compte à la fois des données généalogiques et phénétiques, ce qui amène à prendre en compte l'importance relative des symplésiomorphies, synapomorphies et autapomorphies.

En rapport avec "phénétique"

• cladistique

  

  La cladistique est une méthode de classification par clade, la classification cladistique ou cladisme, basée sur la plus ou moins grande proximité des liens...

• classification

  

  En biologie, la classification est un regroupement des êtres vivants par ensembles hiérarchisés nommés taxons ou résultat de cette action.

• homologie

  

  L'homologie consiste à identifier un caractère commun, homologue à plusieurs êtres vivants, et qu'ils ont hérité de leur ancêtre commun.

• phylogénie

  

  La phylogénie est la science qui étudie les relations de parenté génétique entre les espèces (taxons), incluant l'étude des liens évolutifs entre espèces...