Clade

Définition

En biologie, un clade est un groupe de taxons ayant une origine phylétique commune. Le clade contient cet ancêtre commun et la totalité de ses descendants, formant un ensemble monophylétique dans les ramifications obtenues après avoir fait une seule coupe dans l'arbre phylogénétique. On parle de rameau évolutif monophylétique. Les clades sont étudiés en nomenclature cladistique. La position du clade est indiquée dans un cladogramme.

Des clades dans un cladogramme :

Les clades sont représentés schématiquement comme un arbre ramifié dans un cladogramme.

Explications

L'ancêtre commun peut être un individu, une population, une espèce, qu'elle soit éteinte ou existante, et ainsi de suite jusqu'à atteindre un règne (au sens de classification) dans l'arbre de la vie.

L'évolution sera une divergence concomitante, de sorte que, compte tenu de deux espèces quelconques, dérivée d'un ancêtre commun plus ou moins éloigné dans le temps. Cette considération étant appliquée, l'idéal de la classification biologique est de regrouper les espèces par leur degré de parenté. Ils sont situés plus près de ceux de l'ancêtre commun le plus proche.

L'étude de la parenté des espèces au fil du temps (lignées), l'analyse phylogénétique (avec phylogramme), est désormais réalisée à l'aide de méthodes très efficaces, telles que la comparaison directe des séquences d'ADN et d'autres sources de preuves génétiques : ultrastructure, paléontologie, biochimie. Les arbres phylogénétiques résument ce que l'on sait de l'histoire de l'évolution. Mais ce n'est pas la seule définition de clade.

Comparaison entre clades et taxons

La définition du taxon suivie des codes de la nomenclature internationale, qui réglementent les noms scientifiques appliqués aux plantes, aux animaux et aux bactéries, le définit comme "un groupe d'organismes avec une circonscription, une position et un rang" (rang taxonomique).

La circonscription est la délimitation de l'ensemble, le critère utilisé pour séparer chaque organisme du taxon des autres taxons, selon les codes, doit consister en une description des caractéristiques des organismes du taxon afin qu'il soit utile pour identifier de nouveaux organismes : il doit pouvoir être utilisé pour décider si les nouveaux organismes, après avoir fait une description, appartiennent ou non à ce taxon. En d'autres termes, il doit consister en une description idéalement "diagnostique".

La position taxonomique est constituée par les taxons au sein desquels le taxon est aggloméré, c'est-à-dire les taxons supérieurs auxquels il appartient également, et l'aire de répartition est la "catégorie taxonomique" ou le "rang taxonomique", dont il existe 7 "étages" pour les codes qui, pour des raisons historiques, sont obligatoires : règne (royaume), embranchement (division), classe, ordre, famille, genre, espèce.

Le taxon, selon les codes, n'a pas d'ancêtres hypothétiques, seulement les organismes à l'intérieur desquels les données pour la circonscription ont été prises, mais pourraient être associés à un officieusement.

Un taxon ne doit pas nécessairement correspondre à un clade, car il existe des chercheurs en taxonomie qui ont des raisons de proposer qu'il existe des groupes paraphylétiques qui sont des groupes plus "naturels" que les groupes monophylétiques qui les englobent, de sorte qu'ils généreraient des classifications plus utiles et prédictives (par exemple Cavalier-Smith 2010).

À l'inverse, un grade est un groupe d'êtres vivants rassemblés sur la base de certaines de leurs caractéristiques (par exemple en raison du niveau d'organisation de leur appareil végétatif), indépendamment de leur phylogénie. Le caractère choisi peut ne pas refléter les liens de parenté, voir le cas des "chlorelles".

Histoire

En 1957, Julian Huxley, le biologiste anglais a inventé le mot. Dupuis a dit : "quand il a inventé le terme clade à partir du terme cladogenèse qui a été tiré directement de Rensch, Huxley a tenté de désigner des unités monophylétiques délimitables ou, plus précisément, des unités monophylétiques de toute ampleur".

L'adjectif cladistique était dérivé du clade, pour qui "la proximité des relations généalogiques en termes de lignées phylétiques peut être qualifiée de cladistique..., les similitudes dues à un ancêtre commun, non à une convergence, peuvent être qualifiées de patristiques" et la deux termes se réfèrent aux affinités phylétiques.

La cladistique est une relation "par l'ancêtre commun le plus récent", et patristique, une par ancêtre commun sans autre spécification. Ils assimilent donc une relation cladistique à une Hennigiana.

Le terme cladista a été introduit en 1965 et a deux significations différentes. Pour Mayr, le cladogramme des cladistes est le schéma phylétique de l'école Hennigiana. Pour Camin et Sokal, le terme cladogramme est utilisé "pour distinguer un dendrogramme cladistique d'un phénotype qui pourrait être appelé phénogramme".

Par conséquent, il existe deux types de cladogrammes : ceux qui sont basés sur des attributs et ceux qui sont basés sur des objets (c'est-à-dire sur des constructions phénétiques).

En rapport avec "clade"

• groupe holophylétique

  

  Le groupe holophylétique (taxon holophylétique) se réfère à un groupe monophylétique qui comprend tous les descendants d'un ancêtre.

• groupe monophylétique

  

  En cladistique et phylogénétique, un groupe monophylétique, ou groupe holophylétique, est un ensemble taxinomique phylétique composé des taxons se partageant...

• groupe paraphylétique

  

  Un groupe paraphylétique est un groupe composé de taxons qui se partagent des caractères primitifs, lesquels ne peuvent servir à montrer une parenté.

• groupe polyphylétique

  

  Un groupe polyphylétique est un groupe non naturel, dont les taxons n'ont pas un seul ancêtre en commun.