Pseudomonas

Définition

Les bacilles du genre Pseudomonas sont des bactéries en forme de bâtonnets droits ou courbés, à Gram négatif, à oxydase positive, et strictement aérobies, bien que dans certains cas, elles peuvent utiliser le nitrate comme accepteur d'électrons. Certains membres du genre Pseudomonas sp. sont psychrophiliques, tandis que d'autres synthétisent des sidérophores fluorescentes de couleur jaune-vert. Les espèces Pseudomonas ont en commun la présence de plasmides et ne forment pas de spores.

Vues au microscope électronique, les Pseudomonas forment des bâtonnets à infection :

L'espèce Pseudomonas aeruginosa est une bactérie à mobilité unipolaire avec un aspect nacré et secrète une variété de pigments comme la piocyanine (cyan), la fluorescéine (jaune-vert fluorescent) et piorubine (rouge brunâtre). Elle est souvent pathogène et responsable d'infections, chez l'Humain, d'infections nosocomiales. Effectivement, Pseudomonas aeruginosa a été de plus en plus reconnue comme un pathogène opportuniste émergent en pertinence clinique. Plusieurs études épidémiologiques indiquer, en outre, leur résistance aux antibiotiques qui a augmenté à partir d'échantillons cliniques.

Explications

En raison de leur large diffusion dans la nature, les pseudomonadacées de la famille Pseudomonadaceae ont été observées dès les débuts historiques de la microbiologie. Le nom de genre Pseudomonas pour décrire ces organismes a été défini en termes relativement vagues en 1894, comme étant le genre de bacilles à Gram négatif et une bactérie à flagelle polaire. Peu après, un grand nombre d'espèces ont été assignées au genre. Les Pseudomonodaceae ont été isolées à partir d'un certain nombre de niches écologiques de sorte qu'un grand nombre d'espèces ont intégré le genre. De nouvelles méthodologies et l'émergence d'approches fondées sur les études de macromolécules conservées entre les différents organismes, de nombreuses espèces ont été reclassés.

Les espèces du genre Pseudomonas sont des organismes omniprésents, les bactéries gram négatives y entrent dans le groupe de protéobactéries. Les bactéries ont été isolées à partir de ce genre à la fois dans le sol propre, les produits biogènes contaminés et dans un sol xénobiotique. Elles constituent aussi des microbiotes prédominantes dans la rhizosphère et la phyllosphère des plantes; de même, elles ont été isolées à partir des milieux aquatiques, eau douce et eau de mer. Généralement inoffensives pour les humains, il existe aussi des agents pathogènes opportunistes tels que P. aeruginosa; P. syringae est, elle, un pathogène des animaux et un agent pathogène des plantes.

Ce genre est l'un des plus sujettes à la dégradation de composés organiques, en particulier les souches de l'espèce Pseudomonas putida. Les larges composantes cataboliques potentielles de genre sont indiquées dans de nombreux cas par la présence de déterminants plasmidiques et auto-transmissible. L'ubiquité des bactéries du genre Pseudomonas et leur capacité à exploiter une grande variété de nutriments reflète un système d'adaptation à l'environnement qui sont inégalés chez d'autres genres de bactéries.

Les souches de Pseudomonas sont en mesure de traiter, de réagir et à intégrer, une grande variété de conditions changeantes dans l'environnement. Elles présentent une forte réactivité aux signaux physico-chimiques et biologiques. Les souches décrites sont capables d'acquérir une résistance à des métaux lourds, des solvants organiques et de détergents, ce qui leur permet d'exploiter un large éventail de sources de carbone, de nutriments et de coloniser des milieux et des niches qui sont difficiles à coloniser par d'autres micro-organismes. Il n'est donc pas surprenant que les bactéries du genre Pseudomonas sont considérées comme un paradigme de polyvalence métabolique, et forment des organismes clés dans le recyclage de la matière organique dans des compartiments aérobies des écosystèmes, jouant donc un rôle essentiel dans l'amélioration et le maintien de la qualité de l'environnement. En plus de son utilisation en biodégradation, notamment en aquarium, les espèces du genre Pseudomonas sont utilisées dans diverses applications industrielles telles que la fabrication de processus bioplastiques ou techniques de biocontrôle. La position taxonomique des différentes espèces du genre est sujette à révision.

En aquarium, tant d'eau douce que d'eau de mer, la bactérie Pseudomonas putida est capitale dans les derniers stades de traitement de l'azote pour le bon déroulement du cycle de l'azote, surtout dans le domaine aérobie pour consommer les nitrates NO₃. Elle est certainement plus importante que les trop souvent citées Aeromonas, Nitrosomonas et Nitrobacter vendues dans les solutions de bactéries dénitrifiantes pour le démarrage rapide d'un aquarium.

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