Brin codant

Définition

Le brin codant est celui des deux brins d'un ADN double brin qui est utilisé en complément de celui pour la transcription : le brin non codant ou brin transcrit. Le brin codant est identique à l'ARNm sauf que T remplace U dans le brin codant.

Le brin codant et le brin transcrit de l'ADN :

Le brin codant se différencie du brin transcrit (non-codant) lors de la transcription de l'ADN.

Explications

Lorsqu'on se réfère à la transcription d'ADN, le brin codant est le brin d'ADN qui a le même point de départ que la séquence de l'ARN transcrit produit, avec la thymine remplacée par l'uracile. C'est ce volet qui contient des codons, tandis que le brin non codant contient des anti-codons. Lors de la transcription, l'ARN Pol II se lie au brin non codant, lit les anti-codons, et transcrit leur séquence à synthétiser en un produit de transcription d'ARN avec des bases complémentaires.

Les brins codants et brins matrices sont indissociables. Les termes alternatifs pour les brins sont nombreux : là où un gène existe sur une molécule d'ADN, un brin est le brin codant (ou brin directionnel ou brin non-matrice), et l'autre est le brin non codant (également appelé brin antisens, brin anticodant, brin matrice, ou brin transcrit).

En biologie moléculaire et biochimie, la directionnalité se réfère à l'orientation chimique à partir d'une extrémité d'un seul brin d'acide nucléique. La dénomination chimique des atomes de carbone dans les pentoses nucléotides donne numériquement les noms de 5′ et 3′ (généralement prononcé "cinq prime" et "trois prime" respectivement).

La position relative des structures le long d'un brin d'acide nucléique, y compris de liaison des sites de gènes et de plusieurs protéines, habituellement visibles en amont si elle est vers l'extrémité 5′, ou en aval si vers l'extrémité 3′.

L'importance de cette convention d'appellation réside dans le fait que seuls les acides nucléiques peuvent être synthétisés in vivo dans un sens 5′ à 3′; parce que la polymérase utilisée pour l'assemblage de nouveaux filaments doit se joindre à un nouveau groupe nucléotide 3′-hydroxyle (-OH) par une liaison phosphodiester.

Par convention, les filaments individuels des séquences d'ADN ou d'ARN sont écrites de 5′ vers 3′ (le brin codant est le brin utilisé lors de l'affichage d'une séquence d'ADN. Il est présenté dans la direction 5′ à 3′).

✅ Le brin codant est dirigé dans la direction 3′ vers 5′. Le brin modèle est dirigé dans la direction 5′ vers 3′. Le brin codant a une séquence nucléotidique complémentaire. Le brin modèle n'a aucune séquence complémentaire.

Pendant la transcription, l'ARN polymérase déroule une courte section de la double hélice d'ADN près du début du gène (le site d'initiation de la transcription). Cette section déroulée est connue comme la bulle de transcription. L'ARN polymérase, et avec elle la bulle de transcription, se déplace le long du brin non codant dans la direction opposée, 3′ vers 5′, ainsi que polymériser un brin nouvellement synthétisé dans la direction 5′ vers 3′ ou vers l'aval.

La double hélice d'ADN est rembobinée par l'ARN polymérase à l'arrière de la bulle de transcription. Comme lorsque deux fermetures à glissière adjacentes fonctionnent, lorsqu'elles sont tirées l'une vers l'autre, elles s'ouvrent et se dézippent lorsqu'elles avancent dans une direction particulière. Divers facteurs peuvent entraîner la rupture de l'ADN double brin et, ainsi, réorganiser les gènes ou provoquer la mort cellulaire.

Lorsque l'hélice est déroulée, le brin codant est constitué de bases non appariées, tandis que le brin matrice est constitué d'un composite ARN : ADN, suivi d'un certain nombre de bases non appariées à l'arrière.

Cet hybride consiste en les nucléotides les plus récemment ajoutés du transcrit d'ARN, appariés par une base complémentaire au brin matrice. Le nombre de paires de bases dans l'hybride est à l'étude, mais il a été suggéré que l'hybride est formé à partir des 10 derniers nucléotides ajoutés.

Voir aussi un brin sens, un brin directeur et un brin discontinu.

⭐ Le brin codant de l'ADN est le brin qui code pour le gène d'intérêt. Le brin matrice est complémentaire de celui-ci et peut être transcrit pour produire un morceau d'ARN avec une séquence nucléotidique identique au brin codant (sauf que les T seront des U dans l'ARN).

En rapport avec "brin codant"

• ADN complémentaire

  

  L'ADN complémentaire (abrégé en ADNc) est une copie d'ADN d'un ARN messager (ARNm) produite par la transcriptase inverse, car une ADN polymérase peut utiliser...

• ADN antisens

  

  L'ADN antisens distingue un ADN complémentaire synthétisé à partir d'un ARNm qui code pour une protéine.

• brin antisens

  

  Un brin antisens, au contraire d'un brin sens et brin codant, est un ARN viral dont le brin est négatif et qui ne peut pas jouer le rôle d'ARN messager.

• brin sens

  

  Le brin sens, ou brin codant, est un ARN viral dont le brin est positif et qui est susceptible de jouer le rôle d'ARN messager.