Génome du poisson-chat Silurus glanis assemblé

Le génome du poisson-chat Silurus glanis a été séquencé et assemblé pour la première fois. La taille maximale signalée du silure glane d'eau douce est de 5 mètres et jusqu'à 300 kg, ce qui en fait l'une des plus grandes espèces de poissons d'eau douce au monde. En déchiffrant le code génétique de cette espèce géante, les scientifiques s'attendent à mieux comprendre les secrets de la croissance exceptionnellement rapide, de l'énorme appétit et de la longévité du poisson-chat.

En déchiffrant le code génétique du silure glane géant, les scientifiques s'attendent à mieux comprendre les secrets de la croissance exceptionnellement rapide, de l'énorme appétit et de la longévité du poisson-chat Silurus glanis.

C'est une équipe de recherche internationale dirigée par des scientifiques de l'Université estonienne des sciences de la vie qui a pour la première fois réalisé le séquençage et l'assemblage génomique de cette espèce.

Le silure glane vit dans les grands fleuves et lacs européens. Un poisson-chat chasse principalement la nuit et n'est pas un mangeur difficile, avec des invertébrés, des poissons, des grenouilles, des rongeurs et des oiseaux dans son alimentation régulière. Lorsque l'eau est chaude et que la nourriture est abondante, le poisson-chat se développe extrêmement rapidement : les poissons de dix ans peuvent atteindre 1,5 mètres de longueur. Étant donné qu'un poisson-chat peut vivre jusqu'à 80 ans, il n'est pas étonnant qu'il soit devenu à juste titre le poisson trophée prisé et un personnage central de nombreuses légendes chez les pêcheurs à la ligne.

En raison de sa croissance rapide et de sa chair tendre et désossée, le poisson-chat gagne en popularité pour la pêche récréative et l'aquaculture. Le plus grand nombre de silures glanes est capturé dans les eaux intérieures de la Russie, du Kazakhstan et de la Turquie, et sa production aquacole est actuellement d'environ 2000 tonnes par an.

Dans le même temps, le manque d'informations génétiques chez le silure a inhibé l'application des méthodes modernes d'élevage sélectif qui utilisent des informations génomiques au lieu de traits phénotypiques pour estimer les valeurs d'élevage des poissons. "Le génome assemblé du silure glane permet aux chercheurs de trouver des régions génomiques et des variantes génétiques qui ont un impact sur le taux de croissance, l'âge à la maturité sexuelle et la résistance aux maladies. et d'autres caractéristiques pertinentes pour l'aquaculture", a expliqué Riho Gross, professeur titulaire de la chaire d'aquaculture à l'Université estonienne des sciences de la vie, qui a dirigé la recherche.

Selon Anti Vasemägi, chercheur principal de l'Université estonienne des sciences de la vie et professeur de l'Université suédoise des sciences agricoles, qui a participé aux travaux, la taille du génome du poisson-chat gallois peut être comparée à celle d'autres poissons osseux (800 millions de paires de bases), et contient un peu plus de 21 000 gènes. Il a ajouté que l'assemblage du génome servira de tremplin pour de futures recherches visant à résoudre les goulots d'étranglement dans l'aquaculture du poisson-chat et les défis liés à la conservation des populations sauvages.