Banque génomique
Définition
Une banque génomique est un ensemble de clones contenant divers fragments d'ADN. Chaque élément de cette banque de gènes est une bactérie, une levure ou un phage porteur d'un fragment du génome. Elle est composée de clones d'ADN complémentaires (ADNc).
Ces ADN complémentaires représentent le plus grand nombre d'ARNm à un instant donné et d'un type cellulaire donné.
Illustration d'une banque génomique :
La bibliothèque génomique est une collection de fragments d'ADN superposés représentant l'intégralité du génome d'un organisme, clonés dans des vecteurs.
Explications
Une bibliothèque génomique est une collection de fragments d'ADN qui représentent l'intégralité du génome d'un organisme. Ces fragments d'ADN sont stockés dans des vecteurs identiques, chaque vecteur contenant un morceau différent du génome. Les scientifiques extraient d'abord l'ADN des cellules de l'organisme et le découpent en fragments de taille spécifique à l'aide d'enzymes de restriction pour créer une bibliothèque génomique. Ces fragments sont ensuite insérés dans des vecteurs à l'aide d'ADN ligase.
La principale étape de ce procédé implique l'utilisation de la transcriptase inverse d'ARN (dépendante de l'enzyme ADN polymérase) et celle-ci nécessite la présence d'éléments déclencheurs fondamentaux pour initier la synthèse. Souvent pour ce type de procédé de synthèse d'ADNc, l'utilisation d'une amorce est l'étape la plus complexe, qui est contournée grâce à l'utilisation de la queue poly-A présente à l'extrémité 3′ de l'ARNm et de la séquence oligo-complémentaire, utilisé comme déclencheur.
Une fois l'ARNm copié, donnant un ADN simple brin comme produit, une ribonucléase est utilisée pour obtenir des morceaux d'hybrides ADN-ARN, qui seront utilisés comme amorces pour la synthèse du deuxième brin.
Par exemple, les vecteurs sont introduits dans un organisme hôte, tel qu'Escherichia coli ou une levure, chaque cellule hôte ne portant qu'une seule molécule de vecteur. Cela permet une amplification et une récupération faciles de fragments d'ADN spécifiques de la bibliothèque pour une analyse plus approfondie.
Une bibliothèque de gènes, y compris une bibliothèque génomique, une bibliothèque d'ADN ou une banque de gènes, abrite le génome entier d'un organisme sous la forme de fragments d'ADN définis sur des vecteurs dans des organismes porteurs unicellulaires ou des phages. Ces organismes porteurs sont utilisés pour stocker et répliquer les fragments à des fins d'études de biologie moléculaire.
Les bibliothèques génomiques sont essentielles pour les applications de séquençage et ont joué un rôle déterminant dans le séquençage de l'intégralité des génomes de divers organismes, y compris les humains et plusieurs organismes modèles.
Synonymes, antonymes
2 synonymes (sens proche) de "banque génomique" :
- banque de gènes
- bibliothèque génomique
0 antonyme (sens contraire).
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