Holobionte

Définition

Un holobionte regroupe deux organismes holobiontiques, une association par mutualisme ou commensalisme, de deux espèces vivant intrinsèquement ensembles, comme les zooxanthelles vivant avec les coraux par exemple, mais surtout des communautés microbiennes internes ou de surface, les microbiotes d'une microflore. Certains holobiontes (Holobionta) sont classés dans les pelobiontes (Pelobionta).

Schéma de vie d'un holobionte :

Au cours de l'évolution symbiotique avec des microbes, un hôte multicellulaire et ses microbes symbiotiques forment un holobionte. Tous les génomes d'un holobionte sont collectivement appelés un hologénome.

Explications

Les holobiontes sont des assemblages d'espèces différentes qui forment des unités écologiques. Toute association physique entre individus d'espèces différentes pour des portions significatives de leur histoire de vie est une symbiose. L'assemblage complet des génomes dans l'holobionte est appelé un hologène.

Les holobiontes sont traditionnellement divisés en trois grandes divisions : virus, microbes unicellulaires et hôte macrobien. Collectivement, les virus forment le virome et les microbes forment le microbiome. Il n'existe pas de terminologie spécifique pour les autres organismes multicellulaires associés à l'holobionte autre que le symbionte. L'ADN génomique collectif et l'ARN de l'holobionte s'appelle un hologène.

holobiontique (un anglicisme) se dit pour animal qui, toute sa vie, fait partie du même milieu, soit aquatique, soit terrestre, ou qualifie une association holobionte. Dans les cas des poissons, les poissons holobiontiques sont l'opposé des poissons migrateurs.

Pelobionte

Les pelobiontes sont des organismes libres eucaryotes, de grosses amibes. Les pelobiontes sont des hétérotrophes, se nourrissant de bactéries et de petits protistes. Les pelobiontes Pelobionta, également connu sous le nom de caryoblastéens, forment un groupe amitochondriate amiboflagellé, et il a été suggéré qu'ils sont des eucaryotes précoces. Cependant, placer Pelobionta dans une catégorie phylogénétique s'est avéré compliqué. Alors que leurs caractéristiques cytologiques les font paraître anciennes, l'analyse de l'ADNr ne les place pas sur les premières branches.

Il existe plusieurs espèces au sein de Pelobionta, et donc cette classification a de nombreuses structures de génome différentes. Par exemple, la petite sous-unité d'ARN ribosomique de l'espèce de pelobionte Pelomyxa palustris est exceptionnellement longue. L'analyse de l'ARNr de Pelomyxa palustris et d'autres espèces suggère que Pelobionta a émergé après d'autres protistes.

Pelobionta n'a pas de mitochondries. Ils manquent également de dictyosomes empilés. Les pelobiontes sont de forme cylindrique. L'espèce Mastigamoeba balamuthi n'a pas de vésicules golgiennes. Cependant, cela ne signifie pas qu'ils manquent de structures qui rempliront des fonctions similaires. Des gènes au sein de cette espèce sont homologues aux complexes rétromère et adaptine, qui sont liés aux vésicules de Golgi. Les pelobiontes ont des flagelles immobiles dont la fonction est mal connue; la motilité est basée sur les pseudopodes. L'espèce Mastigamoeba schizophrenia a des noyaux appariés et des corps basaux dépourvus de triplets.

Plasmotomie en cours d'un pelobionte Pelomyxa :

Un pelobionte Pelomyxa est en cours de fission binaire (scissiparité) dans une reproduction de type plasmotomie.

La reproduction de Pelobionta est une plasmotomie, qui incorpore à la fois la mitose et la fission binaire. La membrane nucléaire reste intacte tout au long de la division. La duplication produit deux chromatides. Ensuite, le centre d'organisation des microtubules (MTOC) se divise et les microtubules s'assemblent le long des nouveaux MTOC. Enfin, les cellules se séparent.

Les pelobiontes forment des relations symbiotiques avec les bactéries; les bactéries servent de substitut aux mitochondries. On pense que ce manque de mitochondries est une absence secondaire. Il existe trois relations différentes chez les espèces de Pelomyxa. Une bactérie détoxifie l'oxygène, une autre le métabolise et une autre élimine les déchets cellulaires. Les pelobiontes sont capables de survivre dans des environnements pauvres en oxygène. Ce sont des organismes d'eau douce, et peuvent souvent être trouvés vivant dans la boue. Géographiquement, les pelobiontes sont situés dans les régions tempérées de l'hémisphère Nord, le plus souvent en Amérique du Nord. Quelques espèces, comme Mastigamoeba balamuthi, sont des parasites.

En rapport avec "holobionte"

• chlorobionte

  

  Un chlorobionte Chlorobionta est un organisme végétal photosynthétique de couleur verte.

• endobionte

  

  Un endobionte qualifie un parasite ou un symbionte qui vit à l'intérieur d'un substrat de type hôte, qui peut être un organisme ou dans l'endobenthos.

• géobionte

  

  Un géobionte qualifie un organisme animal, appartenant à l'édaphon, qui vit dans le sol (la pédosphère), comme toute espèce géophile.

• halobionte

  

  Un halobionte est un organisme adapté aux milieux salés, aux environnements halins, qui aime vivre avec le sel.