Phylogénétique

Définition

La phylogénétique, considérée comme synonyme de la phylogénie, met en exergue les liens de parenté entre les organismes, de leur généalogie (classification, méthode de reconstruction phylogénétique), ou qui est relatif au cours de l'évolution d'un groupe. Elle est la branche de la génétique qui étudie les modifications génétiques des espèces au cours de l'évolution.

Des représentations phylogénétiques de l'évolution de la vie :

La phylogénétique est un domaine de la génétique et de la bioinformatique, qui traite de l'étude de la descendance (et ascendance) et la décrit en cladogrammes.

Propriétés

Les relations phylogénétiques sont relatives à la phylogenèse, avec l'étude des caractères des ancêtres avec établissement de lignées. Elles sont souvent représentées graphiquement dans un arbre phylogénétique. La phylogénétique examine l'évolution de ces organismes à partir d'ancêtres communs plutôt que les similitudes entre les différents organismes. La cladistique est une méthode d'analyse importante utilisée pour déterminer la phylogénie à partir de synapomorphismes.

La phylogénétique est un domaine de la génétique et de la bioinformatique, qui traite de l'étude de la descendance et du développement phylogénétique. ⭐ Voir aussi la phylogénomique, le cladisme et la classification phylogénétique.

Aujourd'hui, la phylogénétique utilise des algorithmes pour déterminer les degrés de parenté entre différentes espèces ou entre individus d'une espèce de séquences d'ADN précédemment identifiées par séquençage d'ADN. Cela permet de créer un arbre phylogénétique. La phylogénétique est utilisée pour générer des taxonomies. Les algorithmes utilisés incluent la parcimonie, la méthode du maximum de vraisemblance (méthode ML) et l'inférence bayésienne basée sur M CMC. Avant le développement du séquençage de l'ADN et des ordinateurs, la phylogénétique était dérivée des phénotypes via une matrice de distance (phénétique), mais les critères de distinction étaient parfois ambigus, car les phénotypes Les facteurs sont influencés et changent.

Cavalli-Sforza a d'abord décrit la similarité de la phylogénétique des gènes avec l'évolution des langues à partir des langues primordiales. Les méthodes de phylogénétique sont donc également utilisées pour déterminer la descendance par rapport aux langues.

Phylogénie et phylogénétique

⭐ La phylogénie est la relation de parenté entre les espèces ou les taxons en général. Bien que le terme apparaisse aussi en linguistique historique comme désignant la classification des langues humaines en fonction de leur origine commune, le terme est utilisé principalement dans son sens biologique.

⭐ La phylogénétique est la partie de la biologie de l'évolution qui traite de la détermination de la phylogénie. Elle consiste à étudier les relations évolutives entre différents groupes d'organismes à partir de la distribution des caractères primitifs et des dérivés dans chaque taxon, à l'aide de matrices d'information. des molécules d'ADN et de la morphologie. Avec cette information, les arbres phylogénétiques sont établis, base de la classification phylogénétique. Cette classification fait partie de la systématique, qui inclut également les systèmes de classification classique et classique ou Linnéenne.

La nécessité de découvrir l'histoire évolutive des organismes a commencé avec la publication de L'Origine des espèces par Darwin en 1859. L'incorporation de théories de l'évolution dans les systèmes de classification des organismes est un processus qui n'est pas encore achevé aujourd'hui (de Queiroz et Gauthier, 1992). Une étape cruciale de ce processus a été l'acquisition de méthodes explicites permettant d'hypothéquer les relations phylogénétiques, de les tester et de les refléter dans les classifications, méthodes pour lesquelles des biologistes tels que Willi Hennig (entomologiste allemand, 1913–1976), Walter Zimmermann. (Botaniste allemand, 1892–1980), Warren H. Wagner, Jr. (botaniste américain, 1920–2 000) et de nombreux autres ont apporté une contribution précieuse.

Méthodes phylogénétiques

L'enquête sur la parenté se déroule à travers :

• comparer les propriétés morphologiques et anatomiques d'espèces vivantes et de fossiles (maintenant); lorsqu'on étudie les propriétés biologiques d'espèces différentes, il est important de distinguer les homologies d'analogies.
• comparer la biologie du développement et le cycle de vie des espèces vivantes;
• recherche de séquences dans les macromolécules, d'abord principalement d'acides aminés dans les protéines, puis de nucléotides dans l'ADN et dans l'ARN.

Un problème avec la phylogénétique est que le processus qui crée des propriétés (évolution) ne peut généralement pas être observé directement. Par conséquent, des hypothèses doivent parfois être formulées pour parvenir à des phylogénies plausibles. En fonction des propriétés étudiées, il peut exister des divergences d'opinion sur ces hypothèses, qui se traduiront alors par des généalogies phylogénétiques différentes.

La cladistique est aujourd'hui une méthode d'analyse largement utilisée dans le système pour tenter de déterminer les relations évolutives entre les organismes. Une hypothèse importante est la parcimonie maximale. La parcimonie maximale suppose un minimum de changements évolutifs. Une autre hypothèse importante est que la parenté ne peut être évaluée que sur la base des caractéristiques dérivées conjointes, et non sur la base de l'accord des caractéristiques "primitives".

Une homologie indique qu'il existe un plan de construction ou une structure identique grâce à un ancêtre commun. Par exemple, les ailes des oiseaux sont homologues aux pattes des reptiles. Des organes homologues de deux types peuvent avoir des fonctions très différentes. Cependant, le plan du squelette est le même, ce qui ne peut s'expliquer que par la phylogénie. Les homologies peuvent être divisées biologiquement en orthogénies (descendance d'un ancêtre commun) et en paralogies (duplications de gènes au sein d'une espèce).

Dans une analogie, il existe un accord sur une propriété de deux espèces, qui n'est pas causée par la parenté. Cependant, des organes analogues ont la même fonction. De cette manière, les yeux des vertébrés et des céphalopodes se ressemblent au plus tard et ils remplissent également la même fonction. Seulement sous un microscope montre que la construction de cellules est différente. La physiologie du développement montre qu'ils proviennent d'autres couches germinales de l'embryon. Une analogie, contrairement à l'homologie, n'est pas une preuve pour un ancêtre commun.

En rapport avec "phylogénétique"

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