Phylotype
Définition
Un phylotype est un type biologique classant un organisme par sa phylogénétique (évolutive) en relation avec d'autres organismes. Un phylotype est indépendant du taxon (niveau de taxon = classe, ordre, famille, genre), ce qui permet une certaine flexibilité dans le choix du niveau phylogénétique auquel le phylotype est défini, selon la question de recherche spécifique.
Les phylotypes sont des unités taxonomiques opérationnelles regroupant des séquences environnementales par similarité nucléotidique, utilisant généralement une similarité de 97 % du gène ARNr 16S pour estimer les groupes d'espèces.
Explications
Le terme phylotype est neutre pour le niveau de relation, on peut ainsi choisir le niveau phylogénétique à laquelle le phylotype est décrit, par exemple, les espèces, la classe, 97 % de similarité génétique ou homologie.
Le phylotype est un concept couramment employé en microbiologie, où divers outils ont été développés pour inférer les phylotypes bactériens ou les analyser dans des contextes écologiques.
Les phylotypes sont utilisés le plus souvent dans la microbiologie depuis les génomes de procaryotes qui ne se prêtent pas à la classification par la taxonomie linnéenne aussi facilement que de nombreux eucaryotes, y compris les plantes et les animaux.
Le stade phylotypique serait un point de développement où tous les membres dans le taxon se ressemble beaucoup.
Synonymes, antonymes
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