Protomère
Définition
Un protomère est l'unité structurelle d'une protéine oligomère ou du capsomère d'un virus. Un protomère peut être une sous-unité de la protéine ou plusieurs sous-unités différentes. Les sous-unités se rencontrent dans une stoechiométrie définie pour former un oligomère.
La structure cristalline d'un protomère :
Structure cristalline d'un protomère. (a) Vue parallèle à la membrane avec des résidus entièrement conservés (blancs) regroupés au milieu des pores du canal et des résidus également conservés dans les canaux d'urée (jaune). Les flèches rouges montrent l'entrée et la sortie de l'urée. (b) (1) Vue latérale avec périplasme sur le dessus, montrant la forme du canal en jaune, avec les résidus conservés. (2) Gros plan du site de constriction 1, vu depuis le périplasme et gros plan du site de constriction 2.
Explications
En biologie structurale, le protomère est le plus petit ensemble de différentes sous-unités qui composent l'oligomère. Le protomère s'organise généralement sous forme de symétrie cyclique des symétries fermées en groupe de points. Les protomères constituent la principale sous-unité d'une capside virale.
Un monomère est le composant moléculaire unitaire isolé (c'est-à-dire sous forme libre ou soluble) d'un oligomère ou d'un polymère potentiel. Un protomère est la molécule après un changement de conformation dans la forme qu'elle prend lorsqu'elle est incorporée en tant que partie de cet oligomère ou polymère.
Différentes chaînes polypeptidiques (sous-unités) sont classiquement désignées par des lettres grecques. Le nombre de chaque sous-unité du complexe oligomère est indiqué par l'indice, semblable à une formule chimique des éléments.
Par exemples :
- L'hémoglobine est composée de deux chaînes α et de deux chaînes β. La stoechiométrie oligomère est donc α2β2. L'hémoglobine est un hétérotétramère composé de quatre sous-unités (deux α et deux β). C'est un dimère de deux protomères αβ.
- La carbamoyltransférase aspartate a une composition de sous-unités α6β6. Les six αβ-protomères sont disposés en symétrie 3D.
Un protomère fait partie d'un complexe protéique (c'est-à-dire d'une protéine constituée de deux chaînes polypeptidiques ou plus associées), qui est défini de manière à ce que le complexe ne soit constitué que de protomères identiques. Les protomères peuvent à leur tour être constitués d'une ou plusieurs sous-unités différentes (chaînes polypeptidiques).
Dans les virus icosaédriques, les protomères, c'est-à-dire les chaînes polypeptidiques structurelles, sont disposés en groupes oligomères appelés capsomères, qui sont facilement délimités par microscopie électronique à coloration négative et forment la coque fermée de la capside.
Synonymes, antonymes
Voir tous les synonymes pour "protomère".0 synonyme (sens proche) pour "protomère".
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Mots en P à proximité
protogyne protogynie protohormone protolarve protolithe protomèreproton protonation protonème protonéphridie protonophore
En rapport avec "protomère"
Un capsomère est une sous-unité protéique d'une capside virale dont la morphologie peut être très variable, généralement icosaédrique ou hélicoïdal.
Une molécule constitue un oligomère lorsque les radicaux associés sont différents les uns des autres.
Un polymère est une molécule constituée d'une chaîne de molécules semblables et répétitives, appelées monomères.
Une protéine est un nutriment, une grosse molécule organique composée d'une chaîne de plus de 100 acides aminés avec du carbone, de l'hydrogène, de l'oxygène...