Nucléocapside
Définition
Dans un virus, la nucléocapside désigne un ensemble constitué de la capside et de l'acide nucléique. La nucléocapside (N) est une phosphoprotéine qui s'associe au génome de l'ARN viral et forme le noyau de la ribonucléoprotéine. La nucléocapside comporte deux domaines de liaison à l'ARN en N-terminal et C-terminal.
Structure détaillée d'un virus avec sa nucléocapside :
La protéine nucléocapside (N) du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoA) joue un rôle crucial dans sa viabilité et l'empaquetage de son ARN génomique.
Explications
Fréquemment, les termes capside et nucléocapside sont utilisés à tort comme des synonymes. Une seule capside directement associée à l'acide nucléique est également une nucléocapside. Il existe des virus (par exemple le virus de l'immunodéficience humaine VIH) dans lesquels il en existe une deuxième dans la capside externe; ici, seule la partie la plus interne est appelée nucléocapside (ou noyau). À l'intérieur d'une capside, l'acide nucléique peut en outre s'associer à des protéines basiques (par exemple, des histones cellulaires) ou être lié de manière covalente à des protéines (protomères, capsomères). Dans ce cas, on parle de complexe nucléoprotéique.
Certaines capsides n'ont pas de symétrie claire icosaédrique ni hélicoïdale, malgré la structure régulière de leur forme. Ceci est particulièrement visible chez les membres de la famille des Poxviridae (poxvirus). Par conséquent, la symétrie de ces virus est appelée "complexe".
Une position particulière dans les symétries complexes prend les nucléocapsides coniques (coniques) dans les rétrovirus.
Enveloppe de nucléocapside
De nombreux types de virus ont une enveloppe glycoprotéique entourant la nucléocapside. L'enveloppe est composée de deux couches lipidiques entrecoupées de molécules protéiques (bicouche lipoprotéique) et peut contenir du matériel provenant de la membrane d'une cellule hôte ainsi que celui d'origine virale. Le virus obtient les molécules lipidiques de la membrane cellulaire au cours du processus de bourgeonnement viral.
Cependant, le virus remplace les protéines de la membrane cellulaire par ses propres protéines, créant une structure hybride de lipides dérivés de cellules et de protéines dérivées de virus. De nombreux virus développent également des pointes constituées de glycoprotéines sur leurs enveloppes qui les aident à se fixer à des surfaces cellulaires spécifiques.
Formes variées
Les nucléocapsides de plusieurs virus à ARN ont un type de symétrie différent : les capsomères et la ou les molécules d'acide nucléique s'auto-assemblent en hélice. Dans tous ces virus, chaque capsomère consiste en une seule molécule polypeptidique. Les virus végétaux à nucléocapsides hélicoïdales sont en forme de bâtonnets et nus (non enveloppés). Cependant, dans tous les virus animaux, les nucléocapsides hélicoïdales sont enroulées en spirale et enfermées dans une enveloppe de lipoprotéines, peut-être pour donner une stabilité aux très longues nucléocapsides.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "nucléocapside" :
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Mots en N à proximité
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En rapport avec "nucléocapside"
Un crâne anapside est un type d'ostéocrâne d'un vertébré dont le toit dermique crânien est entier, sans fosses temporales dans la région de la joue.
Une capside est une structure complexe et régulière, en forme de capsule, de protéines dans des virus utilisés pour conditionner le génome du virus.
Un crâne diapside caractérise des vertébrés amniotes qui possèdent fondamentalement deux paires de fosses temporales.
Un crâne euryapside se dit d'un type d'ostéocrâne qui ne possède que la fosse temporale supérieure.