Séquençage du génome

Définition

Le séquençage du génome est l'analyse du génome qui détermine la succession de toutes les bases qui composent l'ADN d'un organisme. Le séquençage ne permet pas la détermination de la fonction des protéines codées par l'ADN.

Exemple de séquençage d'un génome :

De nombreuses stratégies et algorithmes de séquençage ont été proposés pour l'assemblage du génome.

Explications

Les scientifiques utilisent un processus appelé séquençage génomique pour décoder les gènes et en savoir plus sur le virus. Il détermine les séquences génétique d'un organisme.

Ce type de séquençage n'est réalisé ou en cours de réalisation que pour un nombre limité d'espèces : quelques bactéries, certains virus, des levures, deux plantes (le riz en particulier), un ver nématode, un insecte (la drosophile) et l'homme. Voir aussi une signature ADN.

Le séquençage génomique permet aux scientifiques d'identifier le coronavirus SRAS-CoV2 et de surveiller son évolution au fil du temps en de nouvelles variantes, de comprendre comment ces changements affectent les caractéristiques du virus et d'utiliser ces informations pour mieux comprendre son impact sur la santé.

Depuis l'achèvement du projet sur le génome humain, les améliorations technologiques et l'automatisation ont augmenté la vitesse et réduit les coûts au point où les gènes individuels peuvent être séquencés régulièrement, et certains laboratoires peuvent séquencer bien plus de 100 000 milliards de bases par an, et un génome entier peut être séquencé. pour seulement quelques milliers de dollars.

Bon nombre de ces nouvelles technologies ont été développées avec le soutien du programme de technologie du génome de l'Institut national de recherche sur le génome humain (NHGRI) et de ses prix de technologie avancée de séquençage de l'ADN.

Une nouvelle technologie de séquençage consiste à observer les molécules d'ADN polymérase alors qu'elles copient l'ADN - les mêmes molécules qui font de nouvelles copies d'ADN dans nos cellules - avec une caméra et un microscope très rapides, et en incorporant différentes couleurs de colorants brillants, un chacun pour les lettres A, T, C et G. Cette méthode fournit des informations différentes et très précieuses de celles fournies par les systèmes d'instruments les plus couramment utilisés.

Une autre nouvelle technologie en développement implique l'utilisation de nanopores pour séquencer l'ADN. Le séquençage d'ADN à base de nanopores consiste à enfiler des brins d'ADN uniques à travers des pores extrêmement minuscules d'une membrane. Les bases d'ADN sont lues une par une à mesure qu'elles se faufilent à travers le nanopore. Les bases sont identifiées en mesurant les différences dans leur effet sur les ions et le courant électrique circulant à travers le pore.L'utilisation de nanopores pour séquencer l'ADN offre de nombreux avantages potentiels par rapport aux méthodes actuelles. L'objectif est que le séquençage coûte moins cher et se fasse plus rapidement. Contrairement aux méthodes de séquençage actuellement utilisées, le séquençage de l'ADN nanopore signifie que les chercheurs peuvent étudier la même molécule encore et encore.

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