Signature ADN
Définition
Une signature ADN est une séquence ADN caractéristique d'un (groupe de) taxon, avec une empreinte génétique donnant un profil génétique et une séquence génétique (signature génétique). Le rôle et la fonctionnalité de séquences nucléotidiques spéciales (les signatures ADN) peuvent détecter la présence d'un organisme et le distinguer de tous les autres.
Les signatures ADN de Vibrio cholerae :
Différentes signatures ADN de Vibrio cholerae sont indiquées. Les organismes sont regroupés verticalement et les dosages sont triés horizontalement par efficacité. Chaque case colorée représente la valeur Ct pour l'une des 3450 expériences de validation. Par exemple, les tests 1 à 5 montrent une forte amplification pour toutes les souches de V. cholerae et une amplification fortement retardée ou échouée pour tous les autres organismes.
Explications
Les signatures ADN sont des séquences nucléotidiques (via séquençage) qui peuvent être utilisées pour détecter la présence d'un organisme et pour distinguer cet organisme de toutes les autres espèces (identification rapide des signatures dans les génomes de bactéries et de virus). Avec la disponibilité de centaines de séquences génomiques bactériennes et virales complètes (pour chaque génome, il y a séquençage de génome), il est maintenant possible d'utiliser des méthodes informatiques pour identifier les séquences de signature dans toutes ces espèces, et d'utiliser ces signatures comme base pour des tests de diagnostic pour détecter et génotyper les microbes dans les deux environnements. et des échantillons cliniques.
Le succès de ces tests dépend de manière critique des méthodes utilisées pour identifier les signatures qui différencient correctement les génomes cibles et le fond de l'échantillon. Les signatures précises pour la plupart des génomes bactériens ont été rendues disponibles sur des sites Web. Un échantillon de ces signatures a été testé avec succès sur un ensemble de 46 Vibrio cholerae, et les résultats indiquent que les signatures sont très sensibles pour la détection ainsi que spécifiques pour la discrimination entre ces souches et leurs proches parents. L'ensemble du complément génomique des organismes est comparé pour identifier les cibles de sonde, est une méthode prometteuse pour le développement de tests diagnostiques et offre aux concepteurs de tests la flexibilité de choisir des sondes parmi les gènes ou les régions génomiques les plus pertinents.
Synonymes, antonymes
1 synonyme (sens proche) de "signature ADN" :
- signature génétique
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à SIGNATURE ADN sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
L'expression SIGNATURE ADN est dans la page 2 des mots en S du lexique du dictionnaire.
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