Silenceur

Définition

Un silenceur correspond à une région de l'ADN qui diminue la transcription d'un gène. Il initie un silençage génétique en modifiant la régulation de l'expression génique dans une cellule qui empêche l'expression d'un gène particulier.

Tout comme les gènes amplificateurs, les gènes silenceurs régulent des processus épigénétiques. Voir l'amplification génique.

Les silenceurs sont moins bien étudiés que les activateurs (et amplificateurs), mais une série récente d'articles a commencé à explorer systématiquement ces éléments de régulation répressifs. Les gènes silenceurs sont importants pour un contrôle précis de l'expression des gènes et sont enrichis pour les variantes de régulation associées à la maladie.

Explications

La capacité de faire taire les gènes joue un rôle important dans la biologie moléculaire et cellulaire et peut être facilement appliquée par transfection. L'expression génique peut être efficacement réduite ou éliminée en introduisant de petites molécules d'ARN non codantes qui inhibent la traduction de l'ARN par le biais d'un processus appelé ARN interférent (ARNi).

Les approches basées sur l'ARNi reposent sur la machinerie cellulaire inhérente, partagée entre plusieurs organismes eucaryotes, pour inhiber la traduction de l'ARNm. On pense que les voies ARNi fournissent un mécanisme pour protéger les cellules des séquences nucléotidiques étrangères (par exemple, les virus et les transposons) mais, plus récemment, elles ont joué un rôle important dans la régulation de l'expression des gènes.

Évolution de la recherche

La plupart des silenceurs récemment découverts sont des éléments régulateurs bifonctionnels qui agissent également comme des activateurs dans d'autres contextes. La distinction traditionnelle entre les exhausteurs et les silenceur peut être une simplification excessive.

Les silenceurs semblent agir par une variété de mécanismes et peuvent appartenir à diverses sous-classes fonctionnellement distinctes. Cela complique la recherche d'une signature prédictive de la chromatine qui permettrait l'identification rapide des silenceurs à partir de données à haut débit.

Comprendre la fonction de silenceur sera essentiel pour prédire l'impact réglementaire de la variation génomique.

Les silenceurs sont des éléments régulateurs de l'ADN qui réduisent la transcription à partir de leurs promoteurs cibles; ce sont les homologues répressifs des activateurs. Bien que découverts il y a des décennies, et malgré les preuves de leur importance dans le développement et la maladie, les silenceurs ont été beaucoup moins étudiés que les activateurs. Récemment, cependant, une série d'articles ont rapporté des études systématiques de silenceurs dans divers systèmes modèles.

Les silenceurs sont souvent des éléments régulateurs bifonctionnels qui peuvent également agir comme des activateurs, selon le contexte cellulaire, et sont enrichis pour l'expression de locus de traits quantitatifs (eQTL) et de variants associés à la maladie. Il n'y a pas encore de preuve d'une "signature de la chromatine silenceur", dans la distribution des modifications d'histones ou des protéines associées, qui soit commune à tous les silenceurs; au lieu de cela, les silenceurs peuvent appartenir à diverses sous-classes, agissant par des mécanismes distincts (et éventuellement se chevauchant).

En rapport avec "silenceur"

• amplification génique

  

  L'amplification génique est une augmentation du nombre de copies d'une séquence génique, d'une région restreinte d'un brin monocaténaire chromosomique.

• expression génique

  

  L'expression génique (ou génétique) est le processus par lequel les informations codées par les acides nucléiques sont transformées dans les protéines...

• transcription

  

  En biologie, la transcription est un processus de synthèse de l'ARN complémentaire à partir d'une matrice d'ADN.

• silençage

  

  Le silençage génétique est la régulation de l'expression génique dans une cellule qui empêche l'expression d'un gène particulier.