Séquençage shotgun
Définition
Le séquençage shotgun est une technique de métagénomique utilisée pour déterminer la séquence d'ADN du génome d'un organisme. Cette technique consiste à fragmenter le génome en de nombreux petits morceaux d'ADN, chacun étant séquencé individuellement.
Ensuite, des programmes de bioinformatique identifient les séquences chevauchantes entre ces fragments et utilisent cette information pour les réassembler dans le bon ordre, reconstituant ainsi le génome.
Schéma d'un séquençage shotgun :
Le séquençage métagénomique par shotgun permet aux chercheurs d'analyser en détail tous les gènes de tous les organismes d'un échantillon complexe. Le séquençage de l'ADN, quant à lui, est une méthode de laboratoire fondamentale utilisée pour déterminer l'ordre précis des nucléotides, ou bases, dans une molécule d'ADN. Ces bases, généralement identifiées par leurs initiales chimiques A, T, C et G, portent les instructions génétiques qui guident le développement et les fonctions cellulaires.
Explications
Pour mieux comprendre ce processus de séquençage aléatoire, imaginez que vous prenez une page d'un livre, que vous en faites des centaines de copies et que ces copies sont introduites dans une machine qui les réduit en bandes contenant des fragments aléatoires des phrases originales. En examinant attentivement chaque bande à la recherche de mots ou de phrases qui se chevauchent, vous pourriez finalement reconstituer le texte complet de la page.
Le séquençage d'ADN par la méthode du "shotgun" ("en un coup de fusil") fonctionne selon un principe similaire car les scientifiques partent d'un fragment d'ADN cloné ou d'un génome entier. L'ADN est fragmenté, générant d'innombrables séquences. Ces séquences sont ensuite analysées par un logiciel conçu pour aligner les parties chevauchantes, reconstituant ainsi l'ADN fragmenté dans sa forme originale.
Synonymes, antonymes
Voir tous les synonymes pour "séquençage shotgun".2 synonymes (sens proche) de "séquençage shotgun" :
- métagénomique shotgun
- séquençage aléatoire
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à SÉQUENÇAGE SHOTGUN sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
L'expression SEQUENCAGE SHOTGUN est dans la page 2 des mots en S du lexique du dictionnaire.
Mots en S à proximité
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En rapport avec "séquençage shotgun"
En biologie, le séquençage est la détermination de l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule, les séquences moléculaires.
Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre des quatre blocs de construction chimiques (appelés bases) qui composent la molécule d'ADN.
Le séquençage du génome est l'analyse du génome qui détermine la succession de toutes les bases qui composent l'ADN d'un organisme.
Le pyroséquençage est une technologie de séquençage de l'ADN sans gel et par synthèse, qui consiste à obtenir des informations génétiques en synthétisant...