Boîte TATA
Définition
Une boîte TATA est une partie du promoteur de l'ADN des procaryotes située à environ dix paires de nucléotides en amont du point de départ de la transcription. Elle est formée de 6 nucléotides pouvant varier, la séquence TATAT correspondant aux nucléotides les plus conservés d'une espèce à l'autre.
La boîte TATA est l'un des sites de liaison des facteurs de transcription les plus importants. Mais les séquences exactes de la boîte TATA ne sont toujours pas très claires.
La régulation de la transcription par une boîte TATA :
La boîte TATA est impliquée dans la régulation de la transcription.
Explications
La boîte TATA est synonyme de boîte de Pribnow, boîte de Goldberg-Hogness, séquence de Pribnow et séquence de Hogness.
La boîte TATA une région de nucléotides qui influencent la transcription des gènes eucaryotes. Elle est une séquence d'ADN non codant trouvée en amont du site d'initiation de la transcription. En fait, elle se trouve dans la région régulatrice, connue sous le nom de promoteur. La boîte TATA est responsable (pas à elle toute seule !) de l'efficacité de la transcription. Elle est une séquence consensus qui n'a pas changé tout au long du processus évolutif.
Avec les procaryotes
Une séquence d'extension boîte TATA est une courte séquence d'ADN qui se compose d'un élément TATA Box et de plusieurs bases flanquant cet élément soit de la gauche, soit de la droite, soit des deux côtés. L'analyse des séquences d'extension de TATA Box apportera plus d'informations sur le mécanisme de liaison entre la TATA Binding Protein et la TATA Box trouvée dans les promoteurs de gènes.
La distribution de fréquence des éléments TATA et des séquences d'extension est analysée sur six ensembles de données de promoteurs humains. Deux des ensembles de données ont été téléchargés à partir de la base de données du génome de l'USCS : l'un comprend 20 647 promoteurs humains à 1 000 bp en amont des sites de début de transcription (TSS), et l'autre comprend 17 516 promoteurs humains à 2000 bp en amont des TSS.
Les promoteurs qui ont été alignés sur leurs TSS sont divisés en un certain nombre de bacs, dont chacun contient 20 pb de chaque gène. La distribution de fréquence des nucléotides simples, des éléments TATA et des séquences d'extension TATA a été étudiée sur différents ensembles de promoteurs. Les résultats des promoteurs humains ont été comparés avec les résultats des promoteurs de souris, de poisson zèbre et de drosophile melanogaster.
Séquence de Hogness
Une séquence de Hogness est synonyme de boîte TATA des eucaryotes, sachant que la séquence est à comprendre comme un enchaînement ordonné des constituants monomériques d'un polymère.
Séquence de Pribnow
La séquence de Pribnow est aux procaryotes ce qu'est la séquence de Hogness aux eucaryotes. Est donc synonyme de boîte TATA des procaryotes.
Synonymes, antonymes
4 synonymes (sens proche) de "boîte TATA" :
- boîte de Goldberg-Hogness
- boîte de Pribnow
- séquence de Hogness
- séquence de Pribnow
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à BOÎTE TATA sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
L'expression BOITE TATA est dans la page 3 des mots en B du lexique du dictionnaire.
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