Taxon

Définition

En biologie, le taxon est une unité taxonomique reconnue par les codes internationaux dans une classification donnée, ou unité systématique telle qu'une famille, un genre, une espèce, etc., pour désigner un organisme sous son nom scientifique. Cette entité conceptuelle est indépendante de son rang en classification classique.

En exemple, le taxon de ces plantes est Cosmos bipinnatus :

Le taxon binomial de cette plante est Cosmos bipinnatus. Le premier mot, cosmos, est le genre (taxon générique) et le second, bipinnatus, est l'espèce dans le genre (taxon spécifique). Son nom vernaculaire français est : cosmos des jardins.

Explications

Un taxon désigne un groupe d'êtres vivants constituant une unité systématique d'un niveau hiérarchique donné (variété, espèce, genre, famille, classe, embranchement, etc.). La science qui étudie les taxons est la taxonomie ou taxinomie. Le taxon est toute unité systématique, indépendamment de son rang. Les taxons sont des mots latinisés, toujours ! Lorsque le taxon est remplacé par un nom commun, il perd son universalité : il est appelé le nom vernaculaire.

La classification peut être exprimée dans un dendrogramme, où chaque noeud représente un taxon possible et les taxons sont regroupés en une hiérarchie d'inclusion.

✅ Le taxon nominal est le basionyme ou protonyme le plus souvent, mais pas toujours. Selon le Code International de nomenclature Zoologique, un taxon nomenclatural. Un concept nomenclatural dénoté par un nom disponible et fondé, réellement ou potentiellement, sur son type porte-nom mais n'ayant pas de limites taxinomiques définies. Un nom employé dans une description originale peut être valide ou synonyme.

Le but de classer les organismes en taxons formellement définis plutôt que des groupes informels, est de fournir des groupes dont la circonscription (ce dont les organismes sont composés) est stricte et dont le nom a une valeur universelle, quelle que soit la langue utilisée pour la communication. Notez que les taxons existent dans une classification donnée, sous réserve de modifications et les écarts qui peuvent survenir; certaines interrogations demeurent parfois complexes sur l'emploi d'un taxon ou un autre, obligeant les descripteurs taxonomistes à préciser dans quel sens l'auteur utilise le nom.

🚩 Le taxon d'une espèce est binomial, il est appelé un binom comme Galium odoratum pour l'aspérule odorante, une plante. Pour le poisson tétra Néon communément appelé le "néon bleu", deux taxons scientifiques sont possibles : il désigne le plus souvent Paracheirodon innesi, mais peut également désigner Inpaichthys kerri (toutefois plus fréquemment appelé le "tétra royal"). Le nom vernaculaire reste ambigu, et sa traduction dans d'autres langues peut sérieusement amener des confusions d'identification.

Taxon et catégorie taxonomique

La définition donnée ici correspond à la définition du taxon de l'école cladiste et de l'évolutionniste, à laquelle un "nom" a été attribué selon les règles écrites dans les codes de la nomenclature internationale. Chaque école de classification regroupe les organismes de manière différente. Dans l'école phénétique, les taxons ne sont pas des groupes de parents mais des organismes ayant des caractéristiques similaires. Dans l'école cladiste, seuls les groupes monophylétiques (regroupés par un ancêtre et tous leurs descendants) sont des taxons, dans l'école évolutive les groupes paraphylétiques peuvent aussi être des taxons. On peut dire qu'en général, un taxon est un groupe d'organismes associé à un ensemble d'attributs qui déterminent l'appartenance de ces organismes à ce groupe. Dans l'école cladista, l'ensemble des attributs sont les caractères hérités de leur ancêtre commun.

Dans le système de classification linnéenne, chaque taxon a également une catégorie taxonomique qui lui est associée hiérarchiquement dans un système de classification.

Les codes internationaux de nomenclature prévoient que les taxons ont un et un seul "nom correct", le nom à utiliser pour désigner le taxon. Pour cela, l'auteur doit publier le nom du taxon dans une revue scientifique, qui doit être en latin, associée à une catégorie taxonomique, à un "type" et à une description s'il s'agit d'une espèce. Le premier nom publié dans la règle est le "nom correct" du taxon. Le nom est appliqué à un taxon qui a le type dans sa circonscription. Dans les codes, le taxon est défini par sa circonscription, sa position (ses relations avec les autres taxons dans un système de classification) et sa catégorie taxonomique.

Pour classer les organismes, la taxonomie utilise de Carl Linnée un système hiérarchique. Dans ce schéma d'organisation, chaque groupe d'organismes en particulier est un taxon et le niveau hiérarchique dans lequel il est placé est sa catégorie. De même, en géographie politique : le pays, la province et la municipalité seraient des catégories, tandis que le Canada, l'Ontario et Toronto seraient des taxons. De la même manière : la famille, le genre et les espèces sont des catégories taxonomiques, tandis que Rosaceae (les roses), Rosa et Rosa canina sont des exemples de taxons de ces catégories.

Il convient de noter que l'association d'un taxon à une certaine gamme (catégorie) est quelque peu relative et limitée au schéma particulier utilisé (système). À tel point qu'un taxon est susceptible d'occuper différentes catégories selon les systèmes de classification (organisés par différents auteurs, critères, etc.); En général, cela se fait dans le cadre des catégories les plus complètes (famille, ordre, classe, etc.).

Ontologie des taxons

Le statut ontologique des taxons est l'un des problèmes les plus discutés dans la philosophie de la biologie. Il y a principalement deux flux :

• le nominalisme, qui nie l'existence réelle des taxons dans la nature, arguant qu'ils ne sont rien d'autre que des constructions mentales du taxonomiste. Dans cette perspective, les taxons sont identifiés avec des catégories taxonomiques.
• l'essentialisme, qui affirme la réalité des taxons, bien que, selon le critère de réalité utilisé, le terme essentialiste embrasse une variété de positions philosophiques très différentes :
  • La métaphysique pré-évolutionniste identifie les taxons avec les types idéaux et éternels créés par le Divin. Dans la taxonomie linnéenne, les taxons sont considérés comme des classes d'individus.
  • La morphologie transcendantale des philosophes naturalistes conçoit les taxons comme des types dérivés d'une série limitée de plans structurels.
• Beaucoup de biologistes évolutionnistes ont essayé de trouver des critères pour caractériser les taxons comme des entités réelles sans tomber dans l'essentialisme fixiste : des auteurs, appliquant la définition des espèces de Simpson, conçoivent les taxons comme des individus évolutifs : les taxons seraient des lignées qui évoluent séparément des autres et qui ont leur propre histoire et leurs tendances évolutives.

✅ Une typogenèse identifie une période de production de nouveaux taxons au cours de l'évolution, à la faveur d'une pression de sélection forte.

Types de taxons

Le taxon est Groupe taxonomique (systématique) de rang varié qui est représenté par l'ensemble des entités qui répondent à des caractéristiques communes. Un taxon est constitué par la réunion des diverses populations et, si c'est le cas, d'unités taxonomiques de rang inférieur, dont l'ensemble présente des caractéristiques suffisamment distinctes des autres groupes voisins pour qu'il soit érigé en un groupe séparé.

Il existe deux types de taxons :

• Naturel : il est justifié par les caractéristiques et l'histoire évolutive de ses membres, de sorte qu'on peut dire qu'il existe dans la nature. La systématique phylogénétique accepte en tant que taxons naturels chaque espèce particulière ou groupe monophylétique d'organismes, ne comprenant que ceux qui forment un clade ou une branche de l'arbre de l'évolution. La plupart des systématiques acceptent également comme groupes de tailleurs "naturels" (groupes paraphylétiques) dont l'ancêtre commun correspond au groupe.
• Artificiel : il n'existe pas dans la nature, c'est-à-dire des groupes polyphylétiques, dont l'ancêtre commun ne fait pas partie du groupe. Par exemple, les algues ou les protozoaires. Ces groupes ne sont pas valables dans la classification, mais ils sont toujours utilisés pour organiser certaines catégories d'informations scientifiques par leur tradition historique.

⭐ On parle de taxon monotypique lorsqu'il ne contient qu'un (seul et unique) membre de la catégorie immédiatement subordonnée. Par exemple, une famille qui ne contient qu'un seul genre, peu importe le nombre d'espèces que ce genre contient.

Absence d'un taxon

L'absence d'un taxon est une donnée de synthèse déduite de l'analyse de plusieurs occurrences de "non-observation" d'un taxon ou issue de l'expertise prenant en compte l'historique de la présence du taxon et de l'analyse des conditions du milieu (habitat, ressources alimentaires...) sur un territoire et une période de temps définis. L'absence d'un taxon, alors qu'il devrait être présent, doit conduire à considérer l'ensemble du fonctionnement de l'écosystème où existe probablement une cause ayant conduit à cette absence, voire à l'extinction du taxon considéré ou de certaines espèces.

En rapport avec "taxon"

• lignée

  

  Une lignée est constituée par un ensemble d'êtres vivants (ou de gènes) descendant d'un ancêtre commun.

• parataxonomie

  

  La parataxonomie consiste en une utilisation moindre de notions scientifiques poussées, ou du remplacement des taxonomistes dans la pratique et la science...

• rang taxonomique

  

  Un rang taxonomique est une catégorie d'une hiérarchie des taxons dans une classification biologique.

• spécimen type

  

  Le spécimen type est le spécimen (holotype), ou chacun d'un ensemble de spécimens (paratypes), sur lequel la description et le nom d'une nouvelle espèce sont...