Virus assistant (virus auxiliaire)

Définition

Un virus assistant (auxiliaire) est un virus dont la réplication permet à un virus défectif ou à un virusoïde (également présent dans la cellule hôte) de se développer en un agent pleinement infectieux. Le virus auxiliaire fournit des fonctions déficientes à un virus endommagé, afin de permettre à ce dernier d'achever son invasion d'une cellule.

Un virus assistant est un virus qui permet à un virus défectueux approprié de se répliquer lors de l'infection de l'hôte, en fournissant les produits géniques pour lesquels le génome défectueux ne code pas.

Cas de génétique inverse à base de virus assistant :

Vue d'ensemble de la génétique inverse à base de virus auxiliaire pour le gène NSP2. Des cellules Cos-7 exprimant la polymérase T7 ont été transfectées avec le plasmide pBS qui code pour un ARN NSP2+. Suite à l'infection des cellules avec le RV auxiliaire sensible à la température (ts) (SA11-tsE) à 31 °C, l'ARN NSP2+ dérivé du plasmide (rouge) est réassorti dans une partie de la progéniture virale, ce qui les rend recombinants (rSA11). Les virus recombinants sont conçus pour avoir un gène NSP2 qui résiste à la dégradation de l'ARNsh et code pour une protéine non sensible à la température (ts). Après deux cycles de croissance à 39 °C dans des cellules MA104g8D exprimant l'ARNsh, la croissance de SA11-tsE est supprimée et rSA11 est sélectionné avec une efficacité d'environ 85 % pour le contrôle de type sauvage.

Explications

Les virus auxiliaires peuvent exploiter les mécanismes de silençage de l'ARN des plantes hôtes pour contrôler l'accumulation d'ARNsat. L'accumulation d'ARNsat du CymRSV dépend fortement de la présence du suppresseur de silençage de l'ARN P19 du virus auxiliaire, ce qui suggère qu'un mécanisme de silençage de l'ARN est impliqué dans l'interaction entre le CymRSV et l'ARNsat. De plus, les ARNsi dérivés du CymRSV ciblent l'ARNsat avec une efficacité supérieure à celle des ARNsi dérivés d'un virus auxiliaire apparenté à distance, le CIRV. Ainsi, CymRSV exploite apparemment le système de silençage de l'ARN des plantes hôtes contre l'ARNsat, contrôlant son accumulation.

⭐ Bien que le virus auxiliaire soit défectueux pour la réplication, les révertants de type sauvage résultant de la recombinaison entre l'auxiliaire et la lignée cellulaire complémentaire apparaissent à diverses fréquences lors de la production des vecteurs amplicons (si le virus de type sauvage intervient, à plus de 10–5, faire un nouveau stock de virus auxiliaire). En plus de la possibilité de virus de type sauvage, les virus transduisant des gènes tels que les neurotrophines et les récepteurs pourraient également être potentiellement dangereux. Par conséquent, il convient de travailler dans des conditions de niveau de sécurité biologique 2 et de désinfecter, avec une solution contenant de l'iode, pratiquement tous les matériaux qui entrent en contact avec le virus, y compris les surfaces.

✅ Les satellites viraux végétaux dépendent des virus auxiliaires (VA) pour la réplication, mais leurs génomes partagent peu ou pas de similitude de séquence avec ceux de leurs HV apparentés. Pour utiliser les mécanismes de réplication fournis par leurs VA respectifs et leurs plantes hôtes, les génomes satellites doivent héberger certains éléments essentiels agissant en cis en tant qu'imitateurs pour le recrutement des facteurs requis. Néanmoins, la coexistence des VA et des satellites indique que les satellites doivent utiliser des stratégies de réplication distinctes pour éviter une concurrence trop agressive avec les VA. Les mécanismes de réplication de satellites viraux végétaux sont bien étudiés selon les types de satellites, et ils mettent l'accent sur les mimétismes et les divergences des stratégies de réplication entre les satellites et leurs VA. Une compréhension complète des mécanismes de réplication des satellites viraux végétaux promet de faire la lumière sur les interactions trilatérales entre les plantes hôtes, les VA et les satellites, pour de nouvelles recherches et applications.

Les satellites, comme leurs virus auxiliaires (VA), varient génétiquement car, lors de la réplication, des mutations (sensu lato, c'est-à-dire des substitutions de bases, des insertions, des délétions, des inversions, des recombinaisons) sont introduites dans leurs acides nucléiques produisant ainsi des variants génétiques. La distribution de fréquence des variantes génétiques dans la population d'un organisme définit sa structure génétique, qui peut changer avec le temps dans un processus appelé évolution. L'évolution peut éventuellement conduire à l'émergence de nouveaux taxons, tels que des virus ou des espèces satellites, et un aspect de l'étude de l'évolution consiste à clarifier l'origine et l'histoire des organismes et leurs relations taxonomiques qui en résultent.

Pour les virus et les satellites, cet aspect paléontologique des études évolutives repose presque entièrement sur des reconstructions phylogénétiques basées sur des séquences de nucléotides ou d'acides aminés d'individus existants de différents taxons. Aussi intéressant que soit cet exercice intellectuel, et malgré les grandes avancées méthodologiques de la phylogénétique, il regorge d'embûches, qui s'approfondissent au fur et à mesure que les reconstructions remontant dans le temps tentent de creuser.

L'autre objectif important de l'étude de l'évolution est de comprendre ses mécanismes et la façon dont ils façonnent la structure génétique des populations. L'étude de la variation génétique des populations de virus et de satellites, et des changements dans leur structure génétique, peut être abordée avec une plus grande confiance à partir d'analyses de séquences d'individus existants et, de plus, se prête à l'expérimentation. L'étude de l'évolution des satellites dans cette perspective a abordé des questions centrales de la biologie évolutive et est très pertinente pour comprendre l'émergence de nouvelles maladies virales et pour développer des stratégies de contrôle des maladies. En conséquence, beaucoup d'efforts ont été faits pour comprendre l'évolution de ces satellites qui modulent la pathogénicité de leurs virus auxiliaires.

En rapport avec "virus assistant"

• ARN satellite

  

  L'ARN satellite viral végétal (ARNsat) est un agent ARN sous-viral qui dépend de son virus auxiliaire pour la réplication et l'encapsidationdissémination.

• virus à ADN

  

  Un virus à ADN est un virus dont le matériel génétique est composé d'ADN et n'utilise pas d'ARN comme intermédiaire lors de la réplication.

• virus à ARN

  

  Un virus à ARN est un virus qui utilise l'acide ribonucléique (ARN) comme matériel génétique ou qui, dans son processus de réplication, a besoin d'ARN.

• virus recombinant

  

  Un virus recombinant est un virus produit en recombinant des morceaux d'ADN à l'aide de la technologie de l'ADN recombinant.