Endophénotype

Définition

Un endophénotype (phénotype intermédiaire) est la partie du phénotype d'un organisme qui ne participe pas directement à l'adaptation au milieu de vie, en opposition à l'exophénotype.

Un endophénotype est un trait biologique quantitatif qui est fiable pour refléter la fonction d'un système biologique discret et est raisonnablement héréditaire, et en tant que tel, est plus étroitement lié à la cause profonde de la maladie qu'au phénotype clinique général.

Les endophénotypes de toxicité et exophénotype :

Endophénotypes de toxicité : pour le développement de systèmes modèles pertinents, nous avons besoin d'approches pour relier l'effet DNT observable (= exophénotype; voir encadré rouge) déclenché par un xénobiotique aux effets que ce composé a dans des systèmes de test in vitro (cercles jaunes). Les endophénotypes de toxicité (boîte orange) forment le lien conceptuel entre ce qui est observé chez l'homme ou les animaux de laboratoire et sur quel modèle de systèmes d'essais.

Explications

En médecine, l'endophénotype est une caractéristique intermédiaire qui se situe à mi-chemin entre le fond génétique d'une maladie complexe et le complexe réel des symptômes. Le concept d'endophénotype a été créé dans le but de diviser les troubles complexes, principalement mentaux, en manifestations intermédiaires plus simples, stables et mesurées avec précision qui ont un lien génétique avéré avec la maladie.

Les expressions "marqueur biologique", "trait subclinique", "marqueur de prédisposition" et "marqueur cognitif" ont une signification proche du concept d'endophénotype, mais ne mettent pas en évidence une dépendance génétique clairement traçable.

L'endophénotype est un terme épidémiologique utilisé pour relier les symptômes comportementaux à des phénotypes structurels mieux compris associés à des causes génétiques connues ou à des tests génétiques anormaux. Il est de plus en plus utilisé dans les troubles du développement, en particulier en ce qui concerne les conditions polygénétiques hautement héréditaires telles que le TDAH, l'autisme et de nombreux troubles psychiatriques.

Pour être considéré comme un endophénotype, un biomarqueur doit remplir quatre critères :

1. il est associé à une maladie dans la population;
2. il est héréditaire;
3. il est largement indépendant de l'état (se manifeste chez l'individu, que la maladie soit active ou non);
4. et au sein des familles, l'endophénotype et le coségrégat de la maladie.

Ces critères stricts peuvent ne pas fonctionner pour certains endophénotypes de maladies qui ont des modèles d'hérédité plus complexes et une pénétrance réduite.

Exophénotype

Un exophénotype indique une partie du phénotype d'un organisme qui participe directement à l'adaptation au milieu de vie, au contraire d'un endophénotype.

Les effets phénotypiques du changement chromosomique a traitent des effets sur la fréquence et/ou la distribution des chiasmes, alors que le fait qu'ils affectent ou non l'exophénotype a reçu moins d'attention et est resté controversé.

⭐ Exemple : : les variables morphométriques de l'espèce Leptysma argentina (un insecte sauterelle) ont été analysées en relation avec les polymorphismes chromosomiques pour une fusion centrée et un segment surnuméraire.

La fusion centrée entre les paires 3 et 6 (fusion 3/6) et un segment surnuméraire dans la plus petite paire du complément (S1) se sont révélées systématiquement avoir des effets sur la fréquence et la position du chiasma; des analyses préliminaires avaient cependant montré que la fusion 3/6 pouvait être corrélée à certains effets sur la taille corporelle.

L'analyse du fémur, du tibia, du prothorax et de la longueur totale ainsi que la hauteur du prothorax sur des échantillons plus grands étaient cohérentes en montrant que les deux polymorphismes sont positivement corrélés avec l'augmentation de la longueur totale; dans le cas du segment surnuméraire, cependant, cet effet n'est pas constant sur toutes les populations échantillonnées.

Un changement adaptatif de la taille corporelle peut être obtenu par sélection sur :

1. les facteurs génétiques qui affectent ce trait;
2. ou des polymorphismes chromosomiques avec des effets exophénotypiques.

Ce dernier cas serait plus efficace, car les facteurs génétiques sont généralement polygéniques et, par conséquent, leur réponse à la sélection serait lente. Il est tentant de dire que cela pourrait être le cas pour L. argentina, car chez les sauterelles, l'augmentation de la taille corporelle peut être liée à la tolérance aux environnements froids ou secs.

En rapport avec "endophénotype"

• phénotype

  

  Le phénotype est l'expression du génotype en fonction d'un certain environnement.

• phénotype hétérozygote

  

  Un phénotype hétérozygote précise un phénotype qualitatif produit par un génotype hétérozygote.

• phénotype homozygote

  

  Un phénotype homozygote précise un phénotype qualitatif produit par un génotype homozygote.

• phénotype récessif

  

  En génétique de dominance, un phénotype récessif précise qu'un phénotype qualitatif est produit par un allèle récessif.