Facteur sigma
Définition
Le facteur sigma (σ) est une sous-unité de l'ARN polymérase bactérienne qui se lie aux autres unités au moment de la transcription, afin de lui permettre de reconnaître le promoteur. Les facteurs σ sont un autre mécanisme majeur de réponse aux stimuli environnementaux.
Dès le début de la transcription, le facteur se détache. Il existe plusieurs facteurs sigma qui sont spécifiques d'un promoteur donné.
Rôle du facteur sigma :
Le facteur antisigma SpoIIAB se lie au facteur sigma σF et l'inactive. Lorsque la cellule reçoit un signal externe, la forme phosphorylée de SpoIIAA, un facteur anti-anti-sigma, perd son phosphate et engage SpoIIAB. Cela libère le facteur sigma σF, qui est alors libre d'activer la cascade de sporulation.
Explications
Les facteurs sigma sont des sous-unités de toutes les ARN polymérases bactériennes. Ils sont chargés de déterminer la spécificité de la liaison à l'ADN promoteur et de contrôler l'efficacité avec laquelle la synthèse d'ARN (transcription) est initiée.
Le premier facteur sigma découvert était le sigma70 (σ70) de la bactérie très étudiée Escherichia coli. Sa découverte en 1968 était un résultat inattendu des tentatives de comprendre la structure des sous-unités de l'ARN polymérase. Il a été découvert que l'activité de l'ARN polymérase était associée à deux espèces de protéines.
Des facteurs sigma ont également été découverts qui sont introduits dans la bactérie par le bactériophage et se lient au noyau, provoquant une transcription préférentielle des gènes du phage.
Dans la bactérie sporulante Bacillus subtilis, au moins 14 sigmas ont été découverts et caractérisés qui régulent non seulement des classes de gènes pendant la croissance végétative, mais aussi des gènes pendant le développement de la spore spécialisée, en réponse à la privation de nutriments.
Processus de transcription
Le facteur sigma peut diriger la liaison étroite de l'ARN polymérase aux promoteurs et placer l'enzyme dans une position pour initier la transcription afin qu'elle puisse stimuler l'initiation de la transcription. Étant donné que l'initiation est une étape limitant la vitesse de transcription, le facteur σ peut également stimuler l'allongement car la stimulation de l'initiation peut fournir des chaînes plus initiées pour que la polymérase centrale s'allonge.
Après le début de la transcription, le facteur σ se dissocie de la polymérase centrale au début de l'élongation ou à un stade ultérieur, laissant l'enzyme centrale effectuer l'élongation. Le facteur σ qui avait été libéré de l'holoenzyme d'origine peut alors s'associer à une nouvelle enzyme centrale pour initier un autre cycle de transcription. Par conséquent, le facteur σ peut être réutilisé encore et encore, et c'est ce qu'on appelle le cycle σ.
Facteurs sigma alternatifs
Les facteurs sigma bactériens diffèrent sur le plan opérationnel des autres facteurs de transcription de plusieurs manières : ils (i) sont des sous-unités dissociables de l'acide ribonucléique (ARN) polymérase, (ii) dirigent l'ARN polymérase pour reconnaître des séquences d'ADN promotrices bipartites spécifiques et (iii) favorisent activement le processus. de l'initiation de la transcription.
Les bactéries possèdent une sous-unité sigma principale qui est responsable de la transcription de la plupart des promoteurs (similaire à E. coli σ70), mais divers facteurs sigma alternatifs ont évolué pour diriger l'ARN polymérase vers des ensembles particuliers de promoteurs.
C'est-à-dire que des facteurs sigma alternatifs fournissent une stratégie supplémentaire pour réguler l'activité de transcription génique en modifiant l'affinité de l'ARN polymérase pour les séquences promotrices et induisant ainsi des changements majeurs dans les schémas de transcription globaux.
Les facteurs sigma alternatifs sont répartis en deux familles principales : la famille σ70, un groupe qui présente une homologie structurelle élevée avec les facteurs sigma domestiques, et la famille σ54 non apparentée, qui repose sur un facteur de transcription supplémentaire dépendant de l'ATP pour initier la transcription au niveau du promoteur.
Synonymes, antonymes
0 synonyme (sens proche) pour "facteur sigma".
0 antonyme (sens contraire).
Les mots ou les expressions apparentés à FACTEUR SIGMA sont des termes qui sont directement liés les uns aux autres par leur signification, générale ou spécifique.
L'expression FACTEUR SIGMA est dans la page 1 des mots en F du lexique du dictionnaire.
En rapport avec "facteur sigma"
En enzymologie, un cofacteur est une petite molécule de nature non protéique ou un ion métallique associé à l'enzyme et rendant possible son activité...
Un facteur biologique est constitué des activités ou des composés biologiques ou physiologiques des organismes vivants, du biotique.
Dans les gamètes des vertébrés, le facteur cytostatique (CSF) est la protéine kinase qui stabilise le facteur promoteur (MPF).
facteur d'activation des macrophages
Le facteur d'activation des macrophages (MAF) est une lymphokine qui active les macrophages.