Gène candidat
Définition
Un gène candidat est un gène considéré comme lié à un trait particulier, une caractéristique physique, un rôle physiologique ou une maladie génétique. En raison de sa localisation génomique ou de sa fonction connue, ce gène est pensé comme jouant un rôle dans ce trait, ce qui en fait un candidat pour des études plus approfondies.
Utilisation de gènes candidats :
Lors de l'étude de plusieurs gènes candidats, la priorisation génétique vise à intégrer des données complexes et hétérogènes afin d'identifier les gènes les plus prometteurs pour la validation biologique parmi un ensemble de candidats. Son objectif est d'aider les chercheurs en biologie, confrontés à des quantités considérables de données omiques publiques et privées, à maximiser le rendement de la validation biologique en aval.
Explications
Une connaissance approfondie d'un caractère permet une sélection plus pertinente des gènes candidats en vue d'une analyse approfondie. Par exemple, dans l'étude de la génétique de la taille, les gènes impliqués dans la croissance osseuse, le métabolisme lipidique et les facteurs de croissance insulinomimétiques constituent des candidats particulièrement pertinents.
La sélection des gènes candidats repose sur leur implication fonctionnelle dans la pathogenèse de la maladie ou leur localisation au sein des régions chromosomiques identifiées par les études de liaison.
À chaque étape d'un projet de recherche, les biologistes moléculaires sont amenés à choisir – parfois de manière relativement arbitraire, même après une analyse statistique rigoureuse des données – les gènes ou protéines à étudier plus en détail, tout en excluant certains en raison des contraintes liées aux ressources disponibles. Les approches informatiques intégrant des ensembles complexes et hétérogènes de données — telles que l'expression génique, les séquences, les annotations fonctionnelles et la littérature biomédicale — permettent désormais une priorisation plus éclairée des gènes pour les investigations ultérieures. Ces méthodes augmentent significativement l'efficacité des études subséquentes et revêtent un intérêt croissant pour les chercheurs.
Par ailleurs, un classement élevé d'un gène candidat lors de la priorisation associée à un phénotype est aujourd'hui reconnu comme une preuve contributive indiquant que des mutations affectant ce gène sont responsables du phénotype observé.
Synonymes, antonymes
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Mots en G à proximité
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