Que signifie paralogue ?

Définition paralogue:

Ce qui est paralogue qualifie des gènes issus de plusieurs copies ayant évolué indépendamment, par opposition aux gènes orthologues ou homologues.

Comme pour les structures anatomiques, l'homologie de séquence entre séquences de protéines ou d'ADN est définie en termes d'ascendance partagée. Deux segments de l'ADN peuvent avoir une ascendance partagée en raison d'un événement de spéciation (orthologues) ou d'un événement de duplication (paralogues). L'homologie parmi les protéines ou l'ADN est généralement déduite de leur similarité de séquence. Une similarité significative est une preuve solide que deux séquences sont liées par l'évolution divergente d'un ancêtre commun. Les alignements de séquences multiples sont utilisés pour indiquer quelles régions de chaque séquence sont homologues.

La paralogie et l'orthologie sont opposées et complètent l'homologie, la xénologie, la gamétologie, en génomique évolutive.

Les séquences homologues sont orthologues si elles descendent de la même séquence ancestrale séparée par un événement de spéciation: lorsqu'une espèce diverge en deux espèces distinctes, les copies d'un gène unique dans les deux espèces résultantes sont dites orthologues. Le terme "orthologue" a été inventé en 1970 par l'évolutionniste moléculaire Walter Fitch.

Les séquences homologues sont analogues si elles ont été créées par un événement de duplication dans le génome. Pour les événements de duplication de gènes, si un gène dans un organisme est dupliqué pour occuper deux positions différentes dans le même génome, les deux copies sont paralogues. Les gènes paralogues appartiennent souvent à la même espèce. Ils peuvent façonner la structure de génomes entiers et ainsi expliquer dans une large mesure l'évolution du génome. Les exemples incluent les gènes homéobox (Hox) chez les animaux. Ces gènes ont non seulement subi des duplications géniques au sein de chromosomes, mais également des duplications de génomes entiers. En conséquence, les gènes Hox chez la plupart des vertébrés sont répartis sur plusieurs chromosomes: les grappes HoxA-D sont les mieux étudiées.

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